典型文献
全外显子组测序法鉴定中国Ⅰ型Stickler综合征一家系致病基因
文献摘要：
目的:鉴定Ⅰ型Stickler综合征一家系的致病突变。方法:采用家系调查研究方法，收集2012年6月在汕头国际眼科中心就诊的来自中国潮汕地区的Ⅰ型Stickler综合征一家系。对参与调查的家系成员进行病史采集及临床检查，包括视力、眼压、裂隙灯显微镜和眼底检查等，并由经验丰富的临床医生进行诊断。采集该家系5例患者和4名表型正常者的外周静脉血各5 ml并提取基因组DNA；采用全外显子测序技术及相关生物信息学筛查方法对先证者父亲Ⅲ-5进行全外显子测序及致病突变筛选；采用Sanger测序对突变进行验证；采用SIFT、Polyphen2、MutationTaster分析变异位点致病性；采用氨基酸多序列比对及UniProt结构域预测分析变异位点氨基酸保守性及蛋白质三维结构。结果:该家系为常染色体显性遗传方式。共4代39人，其中患者15例，表型正常者24人。先证者Ⅳ-4右眼高度近视、视网膜脱离、斜视，左眼盲；患者Ⅲ-5右眼高度近视、白内障，左眼眼球萎缩；患者Ⅳ-9双眼高度近视。患者Ⅲ-5全外显子测序结果显示，
COL2A1基因26号外显子c.1693C>T：p.565Arg>Cys位点变异。Sanger测序分析结果显示，
COL2A1突变仅存在于被检患者中，未出现在表型正常者中，符合家系共分离。该变异位点经SIFT、Polyphen2、MutationTaster预测分析为有害性突变，COL2A1蛋白氨基酸序列第565位精氨酸在人、小鼠、大鼠、牛、非洲爪蟾中高度保守，此氨基酸位于该基因的三螺旋功能结构域，此突变使蛋白质在三螺旋重复区域Gly-X-Y发生了变化，X位置的精氨酸残基变为半胱氨酸残基，影响纤维蛋白功能，从而产生致病性。
结论:COL2A1基因c.1693C>T变异为该家系的致病基因变异位点，该变异位点首次在国内报道。
文献关键词：
Ⅰ型Stickler综合征;家系;基因检测;全外显子测序;视网膜脱离;高度近视;COL2A1基因
中图分类号：
作者姓名：
邓芳;曹迎杰;谢丽静;陈少婉;肖小强;张铭志
作者机构：
汕头大学·香港中文大学联合汕头国际眼科中心，汕头 515041
文献出处：
引用格式：
[1]邓芳;曹迎杰;谢丽静;陈少婉;肖小强;张铭志-.全外显子组测序法鉴定中国Ⅰ型Stickler综合征一家系致病基因)[J].中华实验眼科杂志,2022(10):935-939
A类：
Stickler,Polyphen2,1693C,565Arg
B类：
全外显子组测序法,致病基因,致病突变,用家,家系调查,汕头,眼科,国潮,潮汕地区,病史采集,临床检查,视力,眼压,裂隙灯显微镜,眼底检查,经验丰富,临床医生,名表,正常者,外周静脉血,ml,全外显子测序技术,筛查方法,先证者,父亲,Sanger,SIFT,MutationTaster,变异位点,致病性,多序列比对,UniProt,结构域,域预测,预测分析,保守性,蛋白质三维结构,常染色体显性遗传,遗传方式,右眼,高度近视,视网膜脱离,斜视,左眼,眼盲,白内障,眼球萎缩,双眼,COL2A1,Cys,点变异,测序分析,仅存,合家,氨基酸序列,精氨酸,非洲爪蟾,三螺旋,功能结构,重复区,Gly,残基,纤维蛋白,蛋白功能,基因变异,基因检测
AB值：
0.313235
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