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牦牛SOCS3基因的分子特性分析
文献摘要：
为了分析牦牛SOCS3基因的理化性质,本研究利用RT-PCR扩增得到牦牛SOCS3基因编码区,将其翻译成对应的蛋白质氨基酸序列后,利用生物信息学初步分析了其分子特征.结果表明,牦牛SOCS3基因编码区包含690个核苷酸,编码229个氨基酸,与普通牛、水牛、大羚羊、绵羊、骆驼、野猪、虎、大熊猫和人的SOCS3基因核苷酸序列一致性分别为99.71％、99.57％、98.70％、98.26％、98.55％、94.20％、92.75％、92.03％和91.59％.生物信息学预测表明,牦牛SOCS3蛋白属于亲水蛋白,分子式C 1118 H 1750 N 310 O 338 S 6,预计平均分子量25.13 KD,理论等电点8.97,消光系数0.693,脂肪族系数73.23,主要分布在细胞核和细胞质,也分布在线粒体、细胞骨架等,具有潜在的磷酸化位点33个.在结构上,牦牛SOCS3蛋白含有SH2、SOCS盒结构域,二级结构主要以无规则卷曲、α-螺旋为主,还含延伸链和β-转角.本研究结果为进一步研究牦牛SOCS3提供数据信息.
文献关键词：
牦牛;SOCS3;克隆;生物信息
中图分类号：
作者姓名：
毛德才;安添午;张玉;陈莉敏;李华德;罗晓林
作者机构：
四川省草原科学研究院,四川 成都 611743
文献出处：
引用格式：
[1]毛德才;安添午;张玉;陈莉敏;李华德;罗晓林-.牦牛SOCS3基因的分子特性分析)[J].草学,2022(05):64-70
A类：
大羚羊
B类：
牦牛,SOCS3,分子特性,研究利用,基因编码,编码区,翻译成,氨基酸序列,利用生物,初步分析,分子特征,水牛,绵羊,骆驼,野猪,大熊猫,序列一致性,亲水,分子式,平均分子量,KD,等电点,消光系数,脂肪族,族系,细胞核,细胞质,细胞骨架,磷酸化,在结构上,SH2,结构域,二级结构,无规则,卷曲
AB值：
0.366163
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