典型文献
谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析
文献摘要：
脱落酸(ABA)在植物生长发育中起着重要作用,9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是ABA合成过程中的关键限速酶,关于谷子(Setaria italica)NCED基因研究的报道较少.本研究以济谷22为材料,通过RT-PCR克隆得到SiNCED3,生物信息学分析结果表明,其cDNA全长1836 bp,编码611个氨基酸;SiNCED3蛋白相对分子质量为66.36 kD,等电点为6.15,为稳定蛋白,无信号肽,亚细胞定位预测定位于叶绿体中,含一个NCED基因家族典型结构域RPE65,二级结构主要由无规则卷曲和延伸链构成;启动子顺式作用元件分析表明其受光、ABA、生长素等调控.通过qRT-PCR发现,SiNCED3在谷子根、茎、叶、叶鞘、穗等组织中均有表达,根中的表达量最高;干旱、低温以及盐胁迫都可以不同程度地诱导SiNCED3在谷子幼苗中的表达,表明该基因可能参与调控谷子对不同逆境的响应.
文献关键词：
谷子;SiNCED3;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
王艳珂;黎飞飞;陈二影;杨延兵;管延安;高文伟;秦岭
作者机构：
新疆农业大学农学院,新疆 乌鲁木齐 830000;山东省农业科学院作物研究所,山东 济南 250100
文献出处：
引用格式：
[1]王艳珂;黎飞飞;陈二影;杨延兵;管延安;高文伟;秦岭-.谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析)[J].山东农业科学,2022(09):1-7
A类：
SiNCED3
B类：
谷子,基因克隆,表达模式分析,脱落酸,ABA,植物生长发育,类胡萝卜素,加氧酶,合成过程,限速酶,Setaria,italica,基因研究,生物信息学分析,cDNA,全长,bp,白相,相对分子质量,kD,等电点,信号肽,亚细胞定位,定位预测,叶绿体,基因家族,结构域,RPE65,二级结构,无规则,卷曲,启动子,顺式作用元件,生长素,qRT,叶鞘,盐胁迫,幼苗,逆境,表达分析
AB值：
0.383706
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