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刺槐Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的克隆及表达分析
文献摘要：
为了解刺槐(Robinia pseudoacacia)Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的功能,本试验提取刺槐叶片中RNA,采用RACE PCR技术克隆RpKTI基因序列全长,并对其进行生物信息学分析及表达分析.结果表明,RpKTI基因的开放阅读框(ORF)长度为633 bp,共编码210个氨基酸,分子式为C1039 H1586 N258 O307 S5,是一个稳定的酸性疏水蛋白;在氨基酸序列的N端存在一个跨膜区,且在此跨膜区内含有信号肽;具有11个磷酸化位点及1个N-糖基化位点;二、三级结构均以延伸链及无规则卷曲为主.同源性及进化树分析表明,RpKTI基因属于STI超级家族,与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的KTI基因亲缘关系更近.通过实时荧光定量(qRT-PCR)分析发现RpKTI基因在铅镉混合胁迫3 d时,叶中的表达量最高,推测此基因可能在重金属铅镉胁迫下发挥重要作用.本研究为后期RpKTI基因的功能验证及应用研究奠定了理论基础.
文献关键词：
刺槐;RpKTI基因;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
张晓静;董启迪;王霞;张晓娜;周建
作者机构：
河南科技学院园艺园林学院,河南新乡 453003;长垣市林业局,河南长垣 453400;河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心,河南新乡 453003
文献出处：
引用格式：
[1]张晓静;董启迪;王霞;张晓娜;周建-.刺槐Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的克隆及表达分析)[J].山东农业科学,2022(06):10-19
A类：
Kuntiz,RpKTI,C1039,H1586,N258,O307
B类：
刺槐,胰蛋白酶抑制剂,表达分析,Robinia,pseudoacacia,槐叶,RACE,基因序列,全长,生物信息学分析,开放阅读框,ORF,bp,分子式,S5,疏水蛋白,氨基酸序列,信号肽,磷酸化,糖基化位点,三级结构,无规则,卷曲,同源性,进化树分析,STI,蒺藜苜蓿,Medicago,truncatula,亲缘关系,qRT,重金属铅,镉胁迫,功能验证,基因克隆
AB值：
0.299833
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