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典型文献
秦川牛CAP2基因CDS区克隆及表达谱分析
文献摘要:
[目的]克隆秦川牛CAP2基因的编码区序列(CDS),分析该基因在不同组织及原代脂肪细胞分化过程中的表达特征.[方法]采用RT-PCR方法扩增秦川牛CAP2基因的CDS区,运用ProtPram、TMpred、ProtFun 2.1 Server等在线网站进行CAP2蛋白的生物信息学分析;通过油红O染色和qPCR检测成脂标志基因PPARγ和FABP4基因的表达水平以构建牛原代脂肪细胞诱导分化体系;利用qPCR检测分析CAP2基因在秦川牛7种组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和背脂)和原代脂肪细胞分化过程(0~10 d)中的表达.[结果]秦川牛CAP2基因CDS区长1461 bp,编码486个氨基酸,氨基酸序列主要由无规卷曲和α-螺旋构成.CAP2基因在脂肪组织中高表达,极显著(P<0.01)高于其他组织.牛原代脂肪细胞诱导分化过程中,PPARγ和FABP4基因的表达量逐渐上升,与第0天相比第10天时表达量达到最大(P<0.01);与对照组相比,诱导分化组脂滴积累明显增加;CAP2基因表达量也随时间推移逐渐上升,以0 d为对照,第10天表达量最高(P<0.001).[结论]成功克隆了秦川牛CAP2基因全长1461 bp的编码区;CAP2基因在牛脂肪组织中以较高水平表达,且CAP2基因可能参与脂肪生成与分化过程,预测CAP2基因可能是促进成脂分化的转录因子,对维持牛脂肪细胞状态发挥关键作用,可能作为秦川牛肉质性状的候选基因,该研究结果为进一步揭示牛CAP2基因的功能提供基础资料.
文献关键词:
秦川牛;CAP2基因;脂肪细胞;表达模式;生物信息学分析
作者姓名:
高玉红;户春丽;马燕芬;汪书哲;马云
作者机构:
宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室/宁夏大学农学院,宁夏 银川 750021
文献出处:
引用格式:
[1]高玉红;户春丽;马燕芬;汪书哲;马云-.秦川牛CAP2基因CDS区克隆及表达谱分析)[J].畜牧与饲料科学,2022(03):16-24
A类:
ProtPram,TMpred,ProtFun
B类:
CAP2,CDS,表达谱分析,编码区,不同组织,原代,脂肪细胞分化,表达特征,Server,线网,生物信息学分析,过油,qPCR,标志基因,PPAR,FABP4,细胞诱导,诱导分化,检测分析,区长,bp,氨基酸序列,无规,卷曲,脂肪组织,他组织,天时,脂滴,基因表达量,时间推移,全长,脂肪生成,成脂分化,细胞状,秦川牛肉,肉质性状,候选基因,基础资料,表达模式
AB值:
0.239296
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