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麦洼牦牛干扰素-τ基因的克隆及其表达分析
文献摘要:
[目的]克隆麦洼牦牛干扰素-τ(IFN-τ)基因,并检测其在麦洼牦牛不同组织和不同发情周期卵巢组织中的表达水平.[方法]采用反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)技术克隆麦洼牦牛IFN-τ基因,测序后采用不同的生物信息学软件分析其同源性,并预测IFN-τ蛋白的结构和功能.以GAPDH基因为内参基因,采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)检测麦洼牦牛心、肝、脾、肺、肾、胃、小肠、肌肉组织和处于不同发情周期(卵泡期、红体期、黄体期)卵巢组织中IFN-τ基因mRNA的表达水平.[结果]通过RT-PCR扩增得到长598 bp的麦洼牦牛IFN-τ基因,其开放阅读框大小为564 bp,编码氨基酸187个.IFN-τ蛋白二级结构中占比最大的为α螺旋(50.8%),共有15个磷酸化位点,为整体带负电荷、不稳定的亲水性蛋白,其基因序列与大额牛、黄牛有较高的同源性.组织表达谱分析结果表明,麦洼牦牛小肠、肝脏组织中IFN-τ基因mRNA表达水平显著高于其他组织(P<0.05),卵泡期卵巢组织IFN-τ基因mRNA表达水平显著高于红体期和黄体期(P<0.05).[结论]克隆了麦洼牦牛IFN-τ基因,该基因在麦洼牦牛卵泡期卵巢组织中的表达水平最高,提示其可能在卵巢早期发育过程中有一定作用.
文献关键词:
干扰素-τ;麦洼牦牛;卵巢;组织表达
中图分类号:
作者姓名:
高绍帅;唐紫雯;黎汕;程华琴;殷实;李键
作者机构:
西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都610041;青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,四川成都610041;西南民族大学现代生物技术国家民委重点实验室,四川成都610041
文献出处:
引用格式:
[1]高绍帅;唐紫雯;黎汕;程华琴;殷实;李键-.麦洼牦牛干扰素-τ基因的克隆及其表达分析)[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2022(07):9-16
A类:
B类:
麦洼牦牛,干扰素,表达分析,IFN,不同组织,发情周期,卵巢组织,reverse,transcription,生物信息学软件,同源性,结构和功能,GAPDH,内参基因,quantitative,real,qPCR,牛心,小肠,肌肉组织,卵泡期,黄体期,bp,开放阅读框,蛋白二级结构,磷酸化,负电荷,亲水性,基因序列,大额,黄牛,组织表达谱,表达谱分析,肝脏组织,他组织,早期发育
AB值:
0.278002
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