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典型文献
玉米ZmGly3基因的生物信息学与表达特性分析
文献摘要:
逆境如干旱、盐渍等胁迫下,植物细胞会积累超量的甲基乙二醛(MG)等有毒代谢产物.乙二醛酶系统(Gly1、Gly2和Gly3)在MG的降解清除中发挥着极为重要的作用,其中Gly3可以不需要谷胱甘肽(GSH)作辅助因子直接催化MG的降解.本研究利用DNAMAN 8.0和ProtParam tool等生物信息学软件对玉米ZmGly3基因编码蛋白的理化性质、空间结构和亲缘关系进行了分析,同时利用qRT-PCR方法分析了ZmGly3在不同器官间和不同胁迫处理下的表达差异.结果表明,ZmGly3含有387个氨基酸,理论分子量为41.2 kD,等电点为5.37.该蛋白不含跨膜结构域,猜测为细胞质蛋白.ZmGly3与马蹄芒MlGly3氨基酸序列同源性最高(95.09%),亲缘关系最近.ZmGly3在正常生长条件下的玉米根、茎和叶中均有表达,茎中最高;在干旱和盐胁迫条件下,ZmGly3在玉米根和叶片中的表达量增加,但在茎中的表达,干旱处理下降低而盐处理下升高.可见,ZmGly3参与了植物对干旱和盐胁迫的应答反应,这为将来玉米抗性育种提供了可利用的基因资源.
文献关键词:
玉米;ZmGly3;生物信息学;干旱;盐胁迫;基因表达特性
作者姓名:
于秋鸿;曾黎;宋希云;李军
作者机构:
青岛农业大学农学院, 山东 青岛 266109
文献出处:
引用格式:
[1]于秋鸿;曾黎;宋希云;李军-.玉米ZmGly3基因的生物信息学与表达特性分析)[J].山东农业科学,2022(10):11-16
A类:
ZmGly3,Gly1,Gly2,Gly3,MlGly3
B类:
逆境,盐渍,植物细胞,超量,甲基乙二醛,MG,有毒,代谢产物,乙二醛酶,酶系统,谷胱甘肽,GSH,辅助因子,研究利用,DNAMAN,ProtParam,tool,生物信息学软件,基因编码,编码蛋白,和亲,亲缘关系,qRT,不同器官,胁迫处理,表达差异,分子量,kD,等电点,跨膜结构域,猜测,细胞质,马蹄,氨基酸序列,序列同源性,生长条件,盐胁迫,胁迫条件,旱处理,盐处理,应答反应,抗性育种,基因资源,基因表达特性
AB值:
0.351763
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