典型文献
甜菜热激蛋白基因BvHSP18.2的克隆和生物信息学分析
文献摘要：
旨在通过基因克隆及生物信息学分析,预测甜菜小分子热激蛋白BvHSP18.2(LOC104903994)的功能.以甜菜'780016B/12优'为试验材料克隆BvHSP18.2,获得BvHSP18.2基因全长;通过ProtParam too1、SWISS-MODEL、MEGA11等对BvHSP18.2的理化性质、蛋白结构、多序列比对等信息进行分析.RT-PCR扩增得到的BvHSP18.2基因全长为962 bp,编码158个氨基酸,分子式为C928H1466N266O284S6,属亲水性不稳定的小分子热激蛋白家族;该基因编码蛋白含13个磷酸化位点,α螺旋和无规则卷曲等主要构件.进化关系发现BvHSP18.2与藜麦、菠菜的sHSP同源性相似.同时,BvHSP18.2基因启动子区域具有参与防御和应激反应等顺式作用元件,推测其在甜菜生长发育和胁迫应答中发挥重要作用.本结果为进一步开展该基因的功能和遗传调控机制研究奠定了基础.
文献关键词：
甜菜;小分子热激蛋白;BvHSP18.2;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
张琼;王锦霞;孟诗琪;钟鑫爱;刘大丽;兴旺
作者机构：
国家甜菜种质中期库,黑龙江大学,哈尔滨150080;黑龙江大学省高校甜菜遗传育种重点实验室/现代农业与生态环境学院,哈尔滨150080;黑龙江大学省高校生化与分子生物学重点实验室/生命科学学院,哈尔滨150080
文献出处：
引用格式：
[1]张琼;王锦霞;孟诗琪;钟鑫爱;刘大丽;兴旺-.甜菜热激蛋白基因BvHSP18.2的克隆和生物信息学分析)[J].中国农学通报,2022(27):111-118
A类：
BvHSP18,LOC104903994,780016B,too1,C928H1466N266O284S6
B类：
甜菜,热激蛋白基因,生物信息学分析,基因克隆,小分子热激蛋白,全长,ProtParam,SWISS,MODEL,MEGA11,蛋白结构,多序列比对,bp,分子式,亲水性,白家,基因编码,编码蛋白,磷酸化,无规则,卷曲,主要构件,进化关系,关系发现,藜麦,菠菜,sHSP,同源性,基因启动子区,启动子区域,应激反应,顺式作用元件,胁迫应答,遗传调控,调控机制
AB值：
0.287508
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