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典型文献
红光熊蜂GS、Akt2基因克隆与低温胁迫表达
文献摘要:
[目的]探究红光熊蜂低温胁迫不同时间、不同温度下GS、Akt2基因的表达差异,为研究红光熊蜂抵御低温胁迫的分子机制提供参考.[方法]以RT-PCR结合RACE技术,克隆、测序红光熊蜂GS、Akt2基因,通过ORF Finder,Prot Param和TBtools等生物信息学软件预测红光熊蜂GS和Akt2蛋白的结构、理化特性以及染色体定位等信息;设计GS、Akt2基因特异性引物,采用实时荧光定量PCR技术检测不同温度、不同处理时间下GS、Akt2基因相对表达量的差异.[结果]红光熊蜂GS基因全长1 417 bp,开放阅读框(ORF)1 020 bp,编码339个氨基酸;GS蛋白二级结构包括无规则卷曲(51.92%)、a-螺旋(23.89%)、延伸链(12.09%)和β-转角(12.09%),具有12个Ser、6个Thr、2个Tyr,可能为GS蛋白激酶磷酸化位点.Akt2基因全长926 bp,ORF为837 bp,编码278个氨基酸;Akt2蛋白二级结构包括α-螺旋(34.89%)、无规则卷曲(33.45%)、延伸链(23.74%)和β-转角(7.91%),具有7个Ser、8个Thr、5个Tyr,可能成为Akt2蛋白激酶磷酸化位点.亚细胞定位GS、Akt2蛋白均存在于线粒体中,为亲水性蛋白,且无信号肽序列,故均为非分泌蛋白.GS、Akt2基因分别位于红光熊蜂1H和3H号染色体上.5~25℃时,红光熊蜂GS基因相对表达量随温度降低而显著下调,而Akt2基因相对表达量则随温度降低呈明显上升趋势,且15℃时其相对表达量显著升高,5℃达到峰值.8℃低温胁迫不同时间,随胁迫时间延长,GS基因相对表达量显著下降;而Akt2基因的相对表达量显著升高,且胁迫12 h达到峰值,随后其相对表达量随胁迫时间延长而缓慢恢复.[结论]红光熊蜂GS、Akt2基因可能通过调控PI3K/Akt或Mtor/FoxO通路以抵御低温胁迫.
文献关键词:
红光熊蜂;基因克隆;低温胁迫;基因表达
作者姓名:
王丹丹;王星;周翘楚
作者机构:
辽东学院农学院,辽宁丹东118000
引用格式:
[1]王丹丹;王星;周翘楚-.红光熊蜂GS、Akt2基因克隆与低温胁迫表达)[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2022(04):115-123
A类:
红光熊蜂
B类:
GS,Akt2,基因克隆,低温胁迫,表达差异,RACE,ORF,Finder,Prot,Param,TBtools,生物信息学软件,软件预测,理化特性,染色体定位,因特,特异性引物,不同处理,处理时间,基因相对表达量,全长,bp,开放阅读框,蛋白二级结构,无规则,卷曲,Ser,Thr,Tyr,蛋白激酶,磷酸化,亚细胞定位,亲水性,信号肽,肽序列,非分,分泌蛋白,1H,3H,PI3K,Mtor,FoxO
AB值:
0.206124
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