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玉米SEs基因家族生物信息学分析
文献摘要：
为获悉玉米S Es基因家族的功能和系统进化关系,利用生物信息学方法对玉米S Es基因家族进行鉴定,同时分析其家族成员理化性质、蛋白质二级结构、进化关系、基因结构、保守结构、氨基酸序列、染色体及启动子顺式作用元件.结果表明,在玉米中共鉴定到10个S Es基因家族成员,编码蛋白质的氨基酸序列长度为320～534 aa,分子量大小为33.85～56.94 kDa,等电点为6.57～9.15;亚细胞定位预测结果表明大部分玉米SEs蛋白定位在细胞质和原生质;系统进化树将玉米SEs基因家族分为3支;基因结构的保守基序分析说明玉米SEs基因家族存在一定的差异性;10个玉米SEs基因家族成员主要分布在Chr1、Chr5和Chr9上;氨基酸多序列比对分析表明10个玉米S Es基因家族成员存在一定的结构相似性;蛋白序列中存在10种M o tif;启动子顺式作用元件分析表明玉米S Es基因主要受光响应、茉莉酸信号响应调控.
文献关键词：
玉米;鲨烯环氧酶;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
吴立仁;张冬雪;唐贵;隋冬华;武新娟;高佳缘;王腾;王璐瑶
作者机构：
黑龙江省农业科学院 经济作物研究所,黑龙江 哈尔滨 150086;黑龙江省农业科学院乡村振兴科技研究所,黑龙江哈尔滨150023
文献出处：
引用格式：
[1]吴立仁;张冬雪;唐贵;隋冬华;武新娟;高佳缘;王腾;王璐瑶-.玉米SEs基因家族生物信息学分析)[J].黑龙江农业科学,2022(07):14-19
A类：
B类：
SEs,基因家族,生物信息学分析,获悉,进化关系,利用生物,生物信息学方法,其家,蛋白质二级结构,基因结构,氨基酸序列,启动子,顺式作用元件,编码蛋白,aa,分子量,kDa,等电点,亚细胞定位,定位预测,明大,蛋白定位,细胞质,原生质,系统进化树,保守基序,Chr1,Chr5,Chr9,多序列比对,比对分析,结构相似性,tif,光响应,茉莉酸信号,响应调控,鲨烯环氧酶
AB值：
0.351447
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