首站-论文投稿智能助手
典型文献
香梨优斑螟EPSXL基因生物信息学及表达分析
文献摘要:
决定香梨优斑螟性别的基因尚不清楚,推测香梨优斑螟Sex-lethal(EPSXL)基因是潜在的主要性别决定基因,拟研究其在雌、雄个体不同组织及发育时期的表达.利用生物信息学软件预测香梨优斑螟EPSXL基因的氨基酸序列、分析蛋白质特性和构建近缘物种进化树,并采用荧光定量PCR技术检测该基因在头、胸、腹、翅中的表达情况.发现EPSXL基因编码区长度为1005 bp,编码334个氨基酸,具有2个保守的RRM结构域.其蛋白为碱性亲水性蛋白质,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,有51个磷酸化位点和2个N-糖基化位点,不存在跨膜结构及信号肽.对比发现,EPSXL氨基酸序列与脐橙螟ATSXL的序列相似性最高.在雄性香梨优斑螟中EPSXL在成虫期和蛹期中mRNA表达量较高,在雌性中则在1龄和3龄幼虫期中表达量较高,在雄性腹部和胸部中的表达量极显著高于雌性相应组织.EPSXL蛋白具有2个保守的功能结构域,该基因mRNA表达在不同性别与组织间差异明显,能够为深入研究其功能提供理论依据.
文献关键词:
香梨优斑螟;EPSXL基因;生物信息学;基因表达
作者姓名:
贺鹏鹏;张来斌;肖海兵;刘振亚;杨明禄;韩旭
作者机构:
塔里木大学 农学院,新疆 阿拉尔 843300;南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室,新疆 阿拉尔 843300
文献出处:
引用格式:
[1]贺鹏鹏;张来斌;肖海兵;刘振亚;杨明禄;韩旭-.香梨优斑螟EPSXL基因生物信息学及表达分析)[J].天津农业科学,2022(04):1-4,9
A类:
EPSXL,ATSXL
B类:
香梨优斑螟,表达分析,Sex,lethal,性别决定基因,不同组织,发育时期,利用生物,生物信息学软件,软件预测,氨基酸序列,蛋白质特性,近缘,物种进化,进化树,基因编码,编码区,区长,bp,RRM,结构域,亲水性,二级结构,无规则,卷曲,磷酸化,糖基化位点,膜结构,信号肽,脐橙,成虫,蛹期,雌性,幼虫,胸部,功能结构
AB值:
0.316791
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。