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十倍体长穗偃麦草Ca2+转运蛋白ThCAX1表达及生物信息学分析
文献摘要：
CAX[Cation(Ca2+)/H+exchanger]基因是重要的Ca2+/H+反向转运蛋白,负责细胞内Ca2+浓度调节.为探讨十倍体长穗偃麦草(Thinopyrum ponticum,2 n=70)中ThCAX1编码基因的序列信息和蛋白结构,以十倍体长穗偃麦草与普通小麦品种百农AK 58远缘杂交后代5 ES易位系为研究材料,分析了ThCA X1序列信息、蛋白结构和互作网络.结果表明,ThCA X 1基因全长编码序列1695 bp,编码565个氨基酸,蛋白分子量59.39 kDa;遗传进化分析表明,该基因来源于十倍体长穗偃麦草5E染色体短臂;蛋白信息预测结果显示,该蛋白为亲水性跨膜蛋白,含5个跨膜结构域,无信号肽,为非分泌性蛋白;二级结构含有25个α螺旋(α-helix)、7个延伸链(extended strand)和26个无规卷曲(random coil);ThCA X 1共有10个蛋白参与互作,其中6个蛋白参与离子交换.
文献关键词：
十倍体长穗偃麦草;ThCAX1基因;生物信息学;Ca2+
中图分类号：
作者姓名：
付丽娜;赵丽敏;胡喜贵;卢柳月;胡铁柱;王玉泉
作者机构：
河南省杂交小麦重点实验室, 河南新乡453003;河南科技学院, 河南新乡453003
文献出处：
引用格式：
[1]付丽娜;赵丽敏;胡喜贵;卢柳月;胡铁柱;王玉泉-.十倍体长穗偃麦草Ca2+转运蛋白ThCAX1表达及生物信息学分析)[J].种子,2022(04):1-6
A类：
十倍体长穗偃麦草,ThCAX1,Thinopyrum,ponticum,ThCA
B类：
Ca2+,转运蛋白,生物信息学分析,Cation,H+exchanger,反向转运,浓度调节,编码基因,序列信息,蛋白结构,普通小麦,小麦品种,AK,远缘杂交,杂交后代,ES,易位系,互作网络,全长,长编,编码序列,bp,分子量,kDa,遗传进化分析,5E,短臂,信息预测,亲水性,跨膜蛋白,跨膜结构域,信号肽,非分,分泌性蛋白,二级结构,helix,extended,strand,无规,卷曲,random,coil,白参,离子交换
AB值：
0.327401
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