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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A基因克隆和功能分析
文献摘要：
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析.结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53％;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31 437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77％)、β-片层(16.14％)、无规则卷曲(55.09％)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系.通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中.实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高.
文献关键词：
怀玉山三叶青;烟草病毒增殖蛋白2 A;基因克隆;亚细胞定位;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
尹明华;曾淑琴;曾荧;张彩霞;张慧博;张丽佳
作者机构：
上饶师范学院生命科学学院,江西上饶334001;上饶农业技术创新研究院,江西上饶334001;上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶市三叶青保育与利用技术创新中心,江西上饶334001
文献出处：
引用格式：
[1]尹明华;曾淑琴;曾荧;张彩霞;张慧博;张丽佳-.怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A基因克隆和功能分析)[J].种子,2022(03):45-51
A类：
B类：
怀玉山三叶青,青烟,烟草,病毒增殖,2A,基因克隆,功能分析,试管苗,转录组数据,生物信息学方法,转基因,瞬时表达,实时定量,序列分析,亚细胞定位,表达分析,cDNA,总长度,bp,G+C,氨基酸组成,分子量,Da,等电点,亲水性,二级结构,片层,无规则,卷曲,三级结构,细胞核,叶绿体,细胞质,硬粒小麦,节节麦,乌拉尔,大麦,二穗短柄草,亲缘关系,未命名,VAH,草叶,定位分析,栽培种,器官特异性
AB值：
0.234675
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