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樱桃绿环斑驳病毒(CGRMV)外壳蛋白基因的克隆及生物信息学分析
文献摘要：
以感染樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottle virus,CGRMV)的甜樱桃叶片为试材,采用RT-PCR和生物信息学分析的方法,研究了樱桃绿环斑驳病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因的核酸序列、进化关系以及蛋白性质和结构,以期为CGRMV的检测及外壳蛋白功能的研究提供参考依据.结果表明:克隆的CGRMV-CP(MW201963)全长807个核苷酸,编码由268个氨基酸残基组成的29.71 kD蛋白.其与17个已报道分离物CP的序列分析显示,核酸序列同源率为75.84％～96.28％,氨基酸一致率为81.72％～98.51％,与来自美国的李树(KC218931.1)进化关系最近.克隆的CGRMV-CP是等电点pI为8.25的疏水性非跨膜蛋白,二级结构由6个α-螺旋,7个β-片层和无规则卷曲构成.
文献关键词：
樱桃绿环斑驳病毒;外壳蛋白;序列分析
中图分类号：
作者姓名：
杨阳;高晨萌;赵真;曹欣然;李庆亮;王德亚
作者机构：
枣庄学院生命科学学院,山东枣庄277160;青岛农业大学植物医学学院,山东青岛266109
文献出处：
引用格式：
[1]杨阳;高晨萌;赵真;曹欣然;李庆亮;王德亚-.樱桃绿环斑驳病毒(CGRMV)外壳蛋白基因的克隆及生物信息学分析)[J].北方园艺,2022(15):10-15
A类：
樱桃绿环斑驳病毒,CGRMV,MW201963,KC218931
B类：
外壳蛋白基因,生物信息学分析,Cherry,green,ring,mottle,virus,甜樱桃,coat,protein,CP,进化关系,蛋白性质,性质和结构,蛋白功能,全长,氨基酸残基,基组,kD,分离物,序列分析,一致率,李树,等电点,pI,疏水性,跨膜蛋白,二级结构,片层,无规则,卷曲
AB值：
0.3073
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