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典型文献
7个桑树AP2/ERF转录因子的生物信息学及表达分析
文献摘要:
AP2/ERF类转录因子是植物所特有的一类转录因子家族,在植物的生长发育及响应非生物胁迫中发挥着重要作用.为发掘桑树AP2/ERF类转录因子的成员及其功能,从桂桑优12中克隆到7个AP2/ERF转录因子,命名为MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF7.生物信息学分析结果表明,这7个AP2/ERF蛋白都属于不稳定蛋白,且均属于亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,亚细胞定位显示主要位于细胞核中.氨基酸序列比对及进化树分析发现,这7个AP2/ERF转录因子均含有1个保守AP2结构域,其中MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF4属于ERF亚家族,MnAP2/ERF5~MnAP2/ERF7属于DREB亚家族.荧光定量分析显示,NaCl、PEG6000、水淹胁迫可诱导7个桑树AP2/ERF基因上调表达,其中MnAP2/ERF3、MnAP2/ERF5、MnAP2/ERF6分别响应水淹、干旱和盐胁迫,说明桑树AP2/ERF转录因子的表达与逆境胁迫响应之间有密切的联系.本研究结果可为进一步揭示AP2/ERF转录因子调控桑树生长发育及逆境胁迫的机理奠定基础.
文献关键词:
桑树;AP2/ERF转录因子;生物信息学分析;基因表达;非生物胁迫
作者姓名:
董亚茹;李茹霞;赵东晓;耿兵;孙景诗;李云芝;王照红
作者机构:
山东省蚕业研究所,山东 烟台 264002
文献出处:
引用格式:
[1]董亚茹;李茹霞;赵东晓;耿兵;孙景诗;李云芝;王照红-.7个桑树AP2/ERF转录因子的生物信息学及表达分析)[J].山东农业科学,2022(01):7-13
A类:
MnAP2,ERF7,ERF5,ERF3,ERF6
B类:
桑树,表达分析,植物所,非生物胁迫,ERF1,生物信息学分析,亲水性,二级结构,无规则,卷曲,亚细胞定位,细胞核,氨基酸序列比对,进化树分析,结构域,ERF4,亚家族,DREB,NaCl,PEG6000,水淹胁迫,盐胁迫,逆境胁迫响应
AB值:
0.16447
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