典型文献
大豆转录因子GmWIN1-1的鉴定与表达分析
文献摘要：
为挖掘参与大豆胁迫应答的调控基因,研究聚焦大豆转录因子WAX INDUCER1(WIN1/SHN1)家族成员的鉴定和功能分析,以拟南芥AtWIN1编码序列为索引,在大豆转录组数据库中进行Blast比对,鉴定获得1条编码大豆GmWIN1-1转录因子的cDNA序列.通过生物信息学方法和qRT-PCR技术分析GmWIN1-1转录因子的序列特征及其在大豆各组织中和干旱胁迫下的表达水平.结果表明,该序列全长570 bp,编码189个氨基酸,蛋白分子质量为21.2 ku,理论等电点为8.45,为亲水性蛋白.GmWIN1-1蛋白二级结构主要元件为无规则卷曲,三级结构建模与模板5wx9.1蛋白氨基酸序列相似性为45％,为单体蛋白.多序列比对揭示GmWIN1-1与AtWIN1相似性最高.保守基序分析表明,WIN1蛋白具有3个基序,即AP2保守基序、中间基序、C端基序.系统发育分析显示,GmWIN1-1与MtWIN1亲缘关系较近.PlantCARE软件预测,GmWIN1-1启动子含有多个响应逆境胁迫的核心顺式元件.实时荧光定量PCR显示,GmWIN1-1在大豆各组织中的表达水平差异显著,在花器官中表达量最高.干旱胁迫条件下,GmWIN1-1的表达水平呈现先小幅度下降而后快速上调再下降的趋势.大豆GmWIN1-1转录因子在大豆各组织中的表达具有时空特异性,并且可能介导大豆干旱胁迫应答的调控.
文献关键词：
大豆;转录因子WAX INDUCER1(WIN1/SHN1);基因鉴定;表达分析;干旱胁迫
中图分类号：
作者姓名：
蔡桂萍;黄旭升;史先飞;李润植;张莉
作者机构：
山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]蔡桂萍;黄旭升;史先飞;李润植;张莉-.大豆转录因子GmWIN1-1的鉴定与表达分析)[J].山西农业科学,2022(03):296-302
A类：
GmWIN1,INDUCER1,WIN1,SHN1,AtWIN1,5wx9,MtWIN1
B类：
大豆,表达分析,胁迫应答,调控基因,焦大,WAX,功能分析,拟南芥,编码序列,索引,转录组数据,Blast,cDNA,生物信息学方法,qRT,序列特征,干旱胁迫,全长,bp,分子质量,ku,等电点,亲水性,蛋白二级结构,无规则,卷曲,三级结构,结构建模,氨基酸序列,多序列比对,保守基序,AP2,端基,系统发育分析,亲缘关系,PlantCARE,软件预测,启动子,逆境胁迫,顺式,花器官,胁迫条件,小幅度,而后快,时空特异性,豆干,基因鉴定
AB值：
0.280857
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