典型文献
苦荞FtF5H基因克隆及表达分析
文献摘要：
阿魏酸-5-羟基化酶(Ferulate 5-hydroxylase)是调控S型木质素合成的关键酶,为研究其在苦荞木质素生物合成途径中的分子机制,该文从苦荞转录组数据中筛选获得一个F5H基因,命名为FtF5H(GenBank登录号:MW455111),采用生物信息学方法对苦荞F5H蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、亚细胞定位、亲疏水性、蛋白质二级结构、蛋白质三级结构、氨基酸结构、系统进化树等进行分析和预测,并运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析FtF5H基因在厚果壳苦荞与薄果壳苦荞的叶、花、茎、果壳中的差异表达.结果表明:(1)FtF5H基因序列包含1395 bp的完整cDNA开放阅读框,编码464个氨基酸.(2)FtF5H蛋白具有P450超家族结构,为亲水性稳定酸性蛋白,不具有跨膜结构域,且为非分泌性蛋白.(3)FtF5H蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,三级结构预测显示FtF5H蛋白与5ylw.1.A的相似度较高.(4)系统进化分析显示FtF5H属于CYP84A亚家族.(5)qRT-PCR显示FtF5H基因在两种苦荞中的不同部位均有表达,且在厚果壳苦荞果壳中的表达量是薄果壳的5倍,表达具有极显著差异.该研究为进一步研究苦荞木质素合成的分子调控机制奠定了基础,对苦荞新品种的培育具有重要意义.
文献关键词：
苦荞;RT-PCR克隆;阿魏酸-5-羟基化酶;生物信息学分析;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
段迎;杨晓琳;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花
作者机构：
山西中医药大学 中药与食品工程学院,太原 030619;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,昆明 650201
文献出处：
引用格式：
[1]段迎;杨晓琳;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花-.苦荞FtF5H基因克隆及表达分析)[J].广西植物,2022(02):304-314
A类：
FtF5H,Ferulate,F5H,MW455111,5ylw,CYP84A
B类：
苦荞,基因克隆,表达分析,阿魏酸,羟基化,hydroxylase,木质素,关键酶,生物合成途径,转录组数据,GenBank,登录号,生物信息学方法,信号肽,亚细胞定位,亲疏水性,蛋白质二级结构,三级结构,系统进化树,qRT,果壳,差异表达,基因序列,bp,cDNA,开放阅读框,P450,超家族,亲水性,跨膜结构域,非分,分泌性蛋白,无规则,卷曲,结构预测,系统进化分析,亚家族,不同部位,分子调控机制,新品种,生物信息学分析
AB值：
0.25062
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