典型文献
秋葵AeMYB1R1转录因子基因克隆及对胁迫的响应
文献摘要:
MYB转录因子家族广泛参与了植物对干旱、盐渍、冷害等非生物胁迫的应答.为了深入研究秋葵[Abel-moschus esculentus(L.)Moench]中的MYB类转录因子,该研究以'北海道1号'秋葵为研究对象,采用PCR方法克隆AeMYB1R1基因,并借助生物信息学进行特征分析;采用qRT-PCR荧光定量方法分析其表达模式及其在非生物胁迫下的表达特性.结果表明:(1)成功克隆获得1个秋葵AeMYB1R1基因;该基因包含1个1 056 bp的开放阅读框,编码352个氨基酸;序列对比和系统进化树结果显示,AeMYB1R1在植物进化过程中具有较高的保守性;AeMYB1R1蛋白分子量为37 891.57 Da,等电点为8.75,含有较多的谷氨酸和较少的色氨酸,以及较多潜在的磷酸化位点和糖基化位点.(2)结构分析显示,AeMYB1R1蛋白主要由α螺旋和无规则卷曲构成,无信号肽和跨膜结构,为疏水性蛋白;同时,氨基酸序列在第104至第156位含有一个保守结构域,表明其属于SHAQKYF类MYB家族转录因子.(3)qRT-PCR结果显示,AeMYB1R1基因在秋葵叶中的表达量最高,其次是根和茎,具有组织表达特性;与高温和低温胁迫相比,在盐胁迫和干旱胁迫中AeMYB1R1表达量更高,说明AeMYB1R1可能是秋葵抗盐和抗旱的关键转录因子.研究结果为AeMYB1R1基因在秋葵生长发育和抗逆机制中的功能研究奠定了理论依据.
文献关键词:
秋葵;AeMYB1R1;非生物胁迫
中图分类号:
作者姓名:
朱志鹏;刘慧玲;吴可鑫;虞健翔;王博文;孙淼
作者机构:
江苏省盐土生物资源研究重点实验室,盐城师范学院海洋与生物工程学院,江苏盐城224002;南京农业大学,作物遗传与种质改良国家重点实验室,南京210095
文献出处:
引用格式:
[1]朱志鹏;刘慧玲;吴可鑫;虞健翔;王博文;孙淼-.秋葵AeMYB1R1转录因子基因克隆及对胁迫的响应)[J].西北植物学报,2022(06):909-919
A类:
AeMYB1R1,moschus,SHAQKYF
B类:
秋葵,基因克隆,盐渍,冷害,非生物胁迫,Abel,esculentus,Moench,北海道,qRT,定量方法,表达模式,bp,开放阅读框,系统进化树,保守性,分子量,Da,等电点,谷氨酸,色氨酸,磷酸化,糖基化位点,无规则,卷曲,信号肽,膜结构,疏水性,氨基酸序列,保守结构域,葵叶,有组织,组织表达特性,低温胁迫,盐胁迫,干旱胁迫,抗盐,抗旱,关键转录因子,抗逆,功能研究
AB值:
0.287905
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