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龙脑樟法呢基焦磷酸合酶基因克隆及表达模式分析
文献摘要：
法呢基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthetase,FPS)是萜类及其衍生物合成的关键限速酶.本研究以龙脑樟为材料,基于转录组测序,克隆CcFPS基因,利用生物信息学软件分析该基因编码的氨基酸序列特征,并采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测CcFPS基因的表达,分析龙脑樟根、茎、叶中该基因的表达与总萜含量的关系.结果表明:CcFPS基因的开放阅读框为1053 bp,编码350个氨基酸,分子量为40.4 kDa,等电点pI为5.25,亲水性平均值(GRAVY)为-0.299.氨基酸同源性与沉水樟最高(98.86％),含有7个相同的保守结构域和2个富含天冬氨酸的基序[DDXX(XX)D].二级结构α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲的比例分别为61.14％、6.57％、2.86％和29.43％,三级结构预测与沉水樟极其相似.系统发育树(NJ树)结果显示,CcFPS蛋白与同为樟科的沉水樟、山苍子的FPS处于同一个分支上.CcFPS基因在龙脑樟的根、茎、叶中均有表达,且表达具有组织特异性,在叶中的相对表达量最高,根中次之,茎中最低.在CcFPS蛋白调控的萜类物质代谢通路中,茎中的总萜含量最高,根中次之,叶中最低.龙脑樟FPS基因表达与总萜含量具有相关性,为进一步解析FPS基因在龙脑樟萜类化合物合成过程中的作用提供参考.
文献关键词：
龙脑樟;法呢基焦磷酸合酶(FPS);基因表达;总萜
中图分类号：
作者姓名：
杨琳;张杭颖;杨帆;朱泽榕;李秋妹;张君诚
作者机构：
三明学院药用植物开发利用福建省高校工程研究中心,福建三明 365004;福建农林大学食品科学学院,福建福州 350000
文献出处：
引用格式：
[1]杨琳;张杭颖;杨帆;朱泽榕;李秋妹;张君诚-.龙脑樟法呢基焦磷酸合酶基因克隆及表达模式分析)[J].热带作物学报,2022(10):1998-2005
A类：
CcFPS,DDXX
B类：
龙脑樟,法呢基焦磷酸合酶,酶基因,基因克隆,表达模式分析,farnesyl,pyrophosphate,synthetase,衍生物,生物合成,限速酶,转录组测序,利用生物,生物信息学软件,基因编码,氨基酸序列,序列特征,qPCR,总萜,开放阅读框,bp,分子量,kDa,等电点,pI,亲水性,GRAVY,同源性,沉水樟,保守结构域,天冬氨酸,基序,二级结构,折叠,无规则,卷曲,三级结构,结构预测,系统发育树,NJ,樟科,山苍子,同一个,有组织,组织特异性,相对表达量,萜类物质,物质代谢,代谢通路,萜类化合物,合成过程
AB值：
0.343498
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