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典型文献
芥蓝SPL基因家族鉴定及表达分析
文献摘要:
SPL存在于所有绿色植物中,在植物生长发育及叶片形成中起着重要的作用.该研究以'改良香菇'芥蓝为材料,采用生物信息学方法,对芥蓝SPL家族(BoSPL)进行全基因组鉴定及分析;采用PCR技术克隆BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2基因,并对芥蓝不同生长时期及不同组织部位进行定量分析,为揭示'改良香菇'芥蓝叶片发育过程的分子机制以及培育芥蓝新品种奠定基础.结果表明:(1)BoSPL家族共有31个成员,编码区蛋白质氨基酸长度在157~1 028 aa之间,BoSPL蛋白质的氨基酸均没有信号肽,属于非分泌蛋白;亚细胞定位预测结果显示,所有的BoSPL家族成员均有定位在细胞核上,少数成员有定位在液泡、叶绿体和细胞质中;BoSPL家族基因包含内含子数量为1~9个,所有成员均包含SBP保守结构域;系统进化分析显示,BoSPL可以分为8个进化群亚组,各群基因数量不等,且BoSPL进化关系与AtSPL相似.(2)成功克隆到BoSPLL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2基因,并成功构建 pCAMBIA1302-35S-BoSPL3-1-GFP、pCAMBIA1302-35S-BoSPL10-2-GFP 和pCAMBIA1302-35S-BoSPL11-2-GFP重组质粒,经根癌农杆菌GV3101介导瞬时转化烟草下表皮细胞,激光共聚焦显微镜检测表明,BBoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2均定位在细胞核中,与预测结果一致.(3)qRT-PCR分析显示,BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2在'改良香菇'芥蓝叶片中相对表达量均较高,但3个基因在叶肉中的相对表达量无明显差异,而BoSPL10-2在花状变形叶中却显著高表达,推测其可能与花状变形叶形成相关.
文献关键词:
芥蓝;BoSPL;全基因组鉴定;亚细胞定位
作者姓名:
曾东琳;唐为玲;曾家晶;Gefu WANG-PRUSKI;赖钟雄;郭容芳
作者机构:
福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002;福建农林大学戴尔豪西大学联合实验室,福州350002
文献出处:
引用格式:
[1]曾东琳;唐为玲;曾家晶;Gefu WANG-PRUSKI;赖钟雄;郭容芳-.芥蓝SPL基因家族鉴定及表达分析)[J].西北植物学报,2022(03):361-370
A类:
BoSPL,BoSPL3,BoSPL10,BoSPL11,AtSPL,BoSPLL3,BBoSPL3
B类:
芥蓝,基因家族鉴定,表达分析,绿色植物,植物生长发育,香菇,生物信息学方法,全基因组鉴定,生长时期,不同组织,组织部位,叶片发育,新品种,编码区,aa,信号肽,非分,分泌蛋白,亚细胞定位,定位预测,细胞核,数成,液泡,叶绿体,细胞质,家族基因,内含子,SBP,保守结构域,系统进化分析,进化关系,pCAMBIA1302,35S,GFP,重组质粒,根癌农杆菌,GV3101,瞬时转化,烟草,表皮细胞,激光共聚焦显微镜,显微镜检测,qRT,相对表达量,叶肉,花状,叶形
AB值:
0.260128
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