典型文献
江西铅山红芽芋TIFY9基因克隆与功能分析
文献摘要：
为了深入探究江西铅山红芽芋TIFY 9基因的功能,通过江西铅山红芽芋试管苗转录组数据库筛选到江西铅山红芽芋TIFY 9基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析.结果表明:江西铅山红芽芋TIFY 9基因cDNA总长度为522 bp,G+C含量为58.62％;由174个氨基酸组成,分子量19073.87 u,等电点9.30,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(31.61％)、β-片层(12.64％)、无规则卷曲(55.75％)构成,三级结构为单体;主要存在细胞核中;在进化上与Colocasia esculenta(芋)的亲缘关系较近,与Colocasia esculenta(芋)hypothetical protein Taro_030839(MQL98131.1)在进化上具有最高的亲缘关系.江西铅山红芽芋TIFY 9蛋白具有典型植物TIFY 9的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种同源性高达100％,在进化上高度保守.烟草叶片亚细胞定位分析表明,TIFY 9定位于细胞质和细胞核中.实时定量PCR结果显示,TIFY 9基因在江西铅山红芽芋中的表达存在器官特异性,在江西铅山红芽芋不同组织部位均有表达,且在叶中和球茎膨大初期表达量最高.在烟草花叶病毒胁迫下,与TIFY 9非转基因烟草相比较,TIFY 9转基因烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著增加,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著下降,表明TIFY 9基因响应病毒胁迫应答可能是依赖光合作用的提高.
文献关键词：
江西铅山红芽芋;TIFY9基因;基因克隆;功能分析;转基因表达
中图分类号：
作者姓名：
赵红;邓雨晴;曾淑琴;曾荧;张彩霞;张慧博;张丽佳;张玲;张妮;尹明华
作者机构：
上饶师范学院生命科学学院,江西上饶334001;上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶农业技术创新研究院,江西上饶334001
文献出处：
引用格式：
[1]赵红;邓雨晴;曾淑琴;曾荧;张彩霞;张慧博;张丽佳;张玲;张妮;尹明华-.江西铅山红芽芋TIFY9基因克隆与功能分析)[J].江苏农业科学,2022(05):41-49
A类：
江西铅山红芽芋,TIFY9,Taro,MQL98131
B类：
基因克隆,功能分析,试管苗,转录组数据,生物信息学方法,瞬时表达,实时定量,序列分析,亚细胞定位,表达分析,cDNA,总长度,bp,G+C,氨基酸组成,分子量,等电点,亲水性,二级结构,片层,无规则,卷曲,三级结构,细胞核,Colocasia,esculenta,亲缘关系,hypothetical,protein,氨基酸序列,同源性,草叶,定位分析,细胞质,器官特异性,不同组织,组织部位,球茎,茎膨大,烟草花叶病毒,转基因烟草,净光合速率,Pn,气孔导度,Gs,蒸腾速率,Tr,最大光化学效率,Fv,Fm,量子效率,PS,qP,电子传递,ETR,非光化学淬灭,NPQ,胁迫应答,光合作用,转基因表达
AB值：
0.277296
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