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典型文献
芒果乙烯响应转录因子MiERF113基因的克隆及表达分析
文献摘要:
芒果(Mangnifera indica L.)是著名的热带水果,深受消费者的喜爱.我国是世界第二大芒果生产国,其中广西为全国最大的芒果产区.芒果是典型的呼吸跃变型水果,其果实在采摘后因乙烯大量释放容易软化腐烂,导致货架期短,影响产业的发展.乙烯响应转录因子(ethylene response factor,ERF)是乙烯信号通路中的关键基因,参与果实内源乙烯合成的信号转导.为了探究ERF在芒果果实采后成熟调控的作用机制,以'台农1号'芒果为研究对象,依据前期完成的芒果转录组数据结果,筛选并克隆得到1个ERF基因(MiERF113),利用生物信息学方法分析MiERF113的基本理化特征、保守结构域、蛋白质结构、进化关系等;利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术对MiERF113基因在芒果采后不同贮藏时期的特异性表达进行分析.结果表明:MiERF113基因的开放阅读框(ORF)长度为681 bp,编码227个氨基酸,预测蛋白质分子量为25.61 kDa,理论等电点(pI)为6.07,总平均亲水性为-0.883,有32个磷酸化位点,无跨膜螺旋结构,无信号肽.蛋白质结构域预测MiERF113蛋白仅含有1个保守的AP2结构域,且该结构域中第14和19位氨基酸分别为丙氨酸和天冬氨酸,符合ERF亚家族的典型结构特征.将芒果与拟南芥、猕猴桃、阿月浑子、苹果、柑橘和茶树的ERF氨基酸序列进行进化分析,发现MiERF113与阿月浑子ERF113的同源性较高,亲缘关系最近.利用qPCR检测MiERF113基因在芒果采后不同贮藏时间果皮和果肉部位的表达情况,结果显示,MiERF113基因在果皮和果肉中均有表达,且随着果实不断成熟其表达量在逐渐增加,在采后贮藏12 d时表达量达到最高.本研究为揭示MiERF113基因在芒果采后成熟过程中的调控作用提供理论依据.
文献关键词:
芒果;乙烯响应转录因子;基因克隆;表达分析
作者姓名:
易萍;黄方;李丽;孙健;胡美姣;毕金峰;滕建文
作者机构:
广西壮族自治区农业科学院农产品加工研究所/广西果蔬贮藏与加工新技术重点实验室,广西南宁 530007;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海南海口 571101;中国农业科学院农产品加工研究所/农业农村部农产品加工重点实验室,北京 100193;广西大学轻工与食品工程学院,广西南宁 530007
文献出处:
引用格式:
[1]易萍;黄方;李丽;孙健;胡美姣;毕金峰;滕建文-.芒果乙烯响应转录因子MiERF113基因的克隆及表达分析)[J].热带作物学报,2022(09):1751-1758
A类:
乙烯响应转录因子,MiERF113,Mangnifera,ERF113
B类:
表达分析,indica,热带水果,芒果生产,生产国,呼吸跃变,变型,采摘后,软化,腐烂,货架期,ethylene,response,关键基因,乙烯合成,信号转导,后成熟,转录组数据,数据结果,利用生物,生物信息学方法,理化特征,保守结构域,进化关系,qPCR,贮藏时期,特异性表达,开放阅读框,ORF,bp,分子量,kDa,等电点,pI,亲水性,磷酸化,螺旋结构,信号肽,蛋白质结构域,域预测,AP2,丙氨酸,天冬氨酸,亚家族,拟南芥,猕猴桃,阿月浑子,苹果,柑橘,茶树,氨基酸序列,进化分析,同源性,亲缘关系,贮藏时间,果皮,果肉,断成,采后贮藏,成熟过程,基因克隆
AB值:
0.320168
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