典型文献
胡椒PnCAD基因的克隆和表达分析
文献摘要：
木质素在植物体中具有运输水分、支撑植株和加强植物体免受侵害等功能,是苯丙烷代谢途径的重要产物之一.其中肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是该途径中重要的限速酶.本研究在胡椒转录组测序的基础上,用RACE法进行克隆,对PnCAD基因全长进行生物信息学分析,并对其蛋白进行理化性质、亚细胞定位和系统进化树等分析;最后运用实时荧光定量PCR进行分析.结果表明:克隆得到CAD基因的全长cDNA,长度为1364 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1071 bp,编码356个氨基酸,预测相对分子量为3.879 kDa,等电点为6.27,属于亲水性蛋白;含有3个N-糖基化特征序列和9个磷酸化位点,可能处于细胞质内.结构域分析发现,胡椒CAD蛋白含有NAD(P)结合位点、多个催化锌和结构锌结合位点.系统进化树分析表明,胡椒CAD与细辛CAD6亲缘关系最近,胡椒和细辛的同源性最高为76％,均隶属于比较原始的双子叶植物.通过荧光定量分析发现,黄花胡椒在辣椒疫霉菌侵染下表达量升高,在8 h达到最高值,约为对照的10倍;之后在24 h时出现小幅度升高,约为对照组的6倍,之后下降.'热引1号'胡椒的表达量在侵染8 h时达到最低,之后缓慢上升.总体来说,所有时间下黄花胡椒基因表达量均高于'热引1号'胡椒,且差异显著.本研究结果可为今后研究胡椒抗非生物胁迫功能提供参考,为PnCAD基因的功能研究提供理论依据.
文献关键词：
胡椒;PnCAD;基因克隆;生物信息学分析;荧光定量PCR
中图分类号：
作者姓名：
孙也乔;王珏;胡丽松;伍宝朵;郝朝运;范睿
作者机构：
海南大学热带作物学院,海南海口 570228;中国热带农业科学院香料饮料研究所,海南万宁 571533;海南省遗传育种与种质资源重点实验室,海南万宁 571533;海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室,海南万宁 571533;海南省Sim Soonliang院士工作站,海南万宁 571533
文献出处：
引用格式：
[1]孙也乔;王珏;胡丽松;伍宝朵;郝朝运;范睿-.胡椒PnCAD基因的克隆和表达分析)[J].热带作物学报,2022(12):2422-2430
A类：
PnCAD,CAD6
B类：
胡椒,表达分析,木质素,植物体,输水,植株,免受,侵害,苯丙烷代谢,代谢途径,肉桂醇脱氢酶,cinnamyl,alcohol,dehydrogenase,限速酶,转录组测序,RACE,全长,长进,生物信息学分析,亚细胞定位,cDNA,bp,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,相对分子量,kDa,等电点,亲水性,糖基化,特征序列,磷酸化,能处,细胞质内,结构域,NAD,结合位点,系统进化树分析,细辛,亲缘关系,同源性,隶属于,双子叶,黄花,辣椒疫霉菌,侵染,最高值,小幅度,基因表达量,抗非,非生物胁迫,功能研究,基因克隆
AB值：
0.349641
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