典型文献
陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析
文献摘要：
[目的]基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析.[方法]克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的方法检测该基因在根、茎、叶、花4个组织中的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式.[结果]成功克隆了陆地棉GhMGD3基因.GhMGD3基因的编码序列全长为681 bp,共编码226个氨基酸,存在3个内含子,分子量是26610.54 Da,等电点为8.74,是稳定的亲水碱性蛋白.二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.该蛋白不存在信号肽、跨膜结构域、N-糖基化位点,但含有多个磷酸化位点.亚细胞定位结果显示:该基因编码的蛋白定位于叶绿体.GhMGD3蛋白与木槿Hibiscus syriacus氨基酸序列相似性较高,其亲缘关系最近.半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均表示:GhMGD3基因主要表达于根,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值.[结论]首次成功克隆到了陆地棉GhMGD3基因,获得了GhMGD3基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,GhMGD3基因在棉花磷高效利用信号调控中具有重要作用.
文献关键词：
陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;周佳敏;张富厚;刘逢举
作者机构：
河南科技大学农学院,河南洛阳471000;河南科技大学洛阳市作物遗传改良与种质创新重点实验室,河南洛阳471000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室,河南安阳455000
文献出处：
引用格式：
[1]孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;周佳敏;张富厚;刘逢举-.陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析)[J].浙江农林大学学报,2022(06):1203-1211
A类：
GhMGD3
B类：
陆地棉,克隆与表达,表达分析,Gossypium,hirsutum,根部,低磷胁迫,基因表达谱芯片,差异表达,序列数据,cDNA,测序分析,生物信息学方法,基因结构,进化关系,半定量,qPCR,基因表达量,表达模式,编码序列,全长,bp,内含子,分子量,Da,等电点,亲水,水碱,二级结构,无规则,卷曲,信号肽,跨膜结构域,糖基化位点,磷酸化,亚细胞定位,定位结果,基因编码,蛋白定位,叶绿体,木槿,Hibiscus,syriacus,氨基酸序列,亲缘关系,中量,相对表达量,最高值,组织表达,棉花,信号调控,基因克隆
AB值：
0.33642
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
