典型文献
马铃薯野生种SpSBP1 基因的克隆及CRISPR/Cas9 载体构建
文献摘要：
为了探究SBP1 基因在植物自交不亲和方面的重要作用,以二倍体马铃薯野生种为材料,利用RT-PCR技术克隆获得马铃薯野生种 SpSBP1(登录号:MZ803088)的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析及 CRISPR/Cas9载体构建.结果显示,SpSBP1 基因的cDNA全长为1176 bp,包含92 bp的5′非编码区和163 bp的3′非编码区,其最大开放阅读框为921 bp,编码306 个氨基酸.蛋白结构域分析显示,SpSBP1 蛋白包括Smc超家族结构域以及RING finger和Zinc finger结构域.蛋白同源序列比对及系统进化树分析显示,马铃薯野生种 SpSBP1 与马铃薯野生种ScSBP1 的同源性最高,其次为花烟草.生物信息学分析显示,SpSBP1 分子质量为 34.73144 ku,理论等电点pI为5.10,推测得出该蛋白为酸性不稳定亲水性蛋白.二级结构预测该蛋白主要由α螺旋和无规则卷曲所构成.同时该蛋白属于非分泌蛋白且不存在跨膜结构.从二倍体马铃薯野生种中克隆出了SpBP1 基因,同时成功构建了CRISPR/Cas9 载体,并进行了遗传转化试验.
文献关键词：
马铃薯野生种;自交不亲和;SpSBP1;克隆;生物信息学分析;CRISPR/Cas9 载体构建
中图分类号：
作者姓名：
陈娜;邵勤;李晓鹏;高阳;卢其能
作者机构：
宜春学院 生命科学与资源环境学院,江西 宜春 336000
文献出处：
引用格式：
[1]陈娜;邵勤;李晓鹏;高阳;卢其能-.马铃薯野生种SpSBP1 基因的克隆及CRISPR/Cas9 载体构建)[J].华北农学报,2022(06):23-33
A类：
马铃薯野生种,SpSBP1,MZ803088,Smc,ScSBP1,SpBP1
B类：
CRISPR,Cas9,载体构建,自交不亲和,二倍体,登录号,cDNA,全长,生物信息学分析,bp,非编码区,大开放,开放阅读框,蛋白结构域,白包,超家族,RING,finger,Zinc,序列比对,系统进化树分析,同源性,花烟草,分子质量,ku,等电点,pI,定亲,亲水性,二级结构,结构预测,无规则,卷曲,非分,分泌蛋白,膜结构,遗传转化
AB值：
0.240277
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