典型文献
重瓣铁线莲鲨烯合酶SQS基因的克隆及表达分析
文献摘要：
[目的]鲨烯合酶是三萜类物质生物合成途径中的限速酶之一.克隆重瓣铁线莲的鲨烯合酶基因(Clematis florida squalene synthase,CfSQS),为利用基因工程技术提高重瓣铁线莲的三萜类次生代谢物的含量、提升重瓣铁线莲的药用价值奠定理论基础.[方法]根据重瓣铁线莲转录组数据并参考其他植物SQS基因设计引物,提取重瓣铁线莲叶片总RNA为模板,利用RT-PCR法扩增并克隆获得CfSQS基因全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析和时空表达分析.[结果]CfSQS ORF序列长度为1227 bp,编码408个氨基酸,预测编码蛋白相对分子量为46.69 kDa,为不稳定、无信号肽的跨膜疏水蛋白,二级结构以α-螺旋(69.61％)和不规则卷曲(22.06％)为主;CfSQS含有鲨烯合酶家族高度保守的氨基酸残基,包括含有4个高度保守且典型的17～23个氨基酸长度的结构域(Ⅰ～Ⅳ)和1个高度差异的疏水区(Ⅴ).系统进化分析表明,CfSQS与黑种草(Nigella sativa L.)等毛茛科植物SQS聚在一类,说明其亲缘关系最近.时空表达分析表明,CfSQS在重瓣铁线莲的根、茎和叶器官中都有表达.[结论]首次克隆了重瓣铁线莲三萜类皂苷上游合成的关键酶基因CfSQS的全长编码序列,并对其进行了生物信息学预测和组织表达分析.研究结果可为进一步研究重瓣铁线莲三萜类皂苷生物合成途径提供参考.
文献关键词：
重瓣铁线莲;三萜皂苷;鲨烯合酶;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
何舒澜;杨谨;黄娴;陈观水
作者机构：
福建卫生职业技术学院,福建 福州 350101;福建农林大学生命科学学院,福建 福州 350002
文献出处：
引用格式：
[1]何舒澜;杨谨;黄娴;陈观水-.重瓣铁线莲鲨烯合酶SQS基因的克隆及表达分析)[J].福建农业学报,2022(11):1430-1437
A类：
重瓣铁线莲,CfSQS
B类：
鲨烯合酶,三萜类物质,生物合成途径,限速酶,隆重,Clematis,florida,squalene,synthase,基因工程技术,技术提高,次生代谢物,升重,药用价值,转录组数据,引物,莲叶,全长,cDNA,生物信息学分析,时空表达,ORF,bp,预测编码,编码蛋白,白相,相对分子量,kDa,信号肽,疏水蛋白,二级结构,卷曲,氨基酸残基,结构域,高度差,水区,系统进化分析,黑种,种草,Nigella,sativa,毛茛科,亲缘关系,关键酶基因,长编,编码序列,组织表达分析,三萜皂苷
AB值：
0.244768
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