典型文献
甘蔗MYB转录因子基因ScMYB52-1的克隆及表达特性分析
文献摘要：
MYB转录因子家族成员广泛参与植物的各种生物学过程,在调控植物适应非生物逆境过程中起关键作用.为分离甘蔗(Saccharum spp.)逆境响应MYB基因并研究其功能,本文应用3'RACE的方法,从甘蔗品种ROC22中克隆到一个R2R3-MYB转录因子基因,命名为ScMYB52-1.生物信息学分析表明,该基因cDNA序列长度为1072 bp,开放阅读框(ORF)长度为696 bp,5'非翻译区长54 bp,3'非翻译区长322 bp.该ORF编码231个氨基酸,推导蛋白的分子量为26.65 kDa,含有2个串联的MYB结构域.ScMYB52-1推导蛋白与模式植物拟南芥中的MYB家族蛋白的进化树聚类分析结果表明,ScMYB52-1蛋白与AtMYB52和AtMYB54的亲缘关系较近;进一步的多序列比对分析结果表明,上述三者蛋白质N端的MYB结构域序列高度一致,且三者的预测蛋白质三级结构类似,表明它们可能具有类似的功能.实时荧光定量PCR结果显示,ScMYB52-1在甘蔗组培苗的根中对PEG处理总体上不敏感,在叶中仅在3 h时短暂上调;ScMYB52-1在叶中受外源ABA和NaCl胁迫的诱导,在处理0.5 h均迅速上调表达,表达量分别为对照的3.35倍和2.75倍,并在处理期维持高于对照的水平;在根中受外源ABA和NaCl胁迫的抑制,在处理0.5 h时就开始下调表达,在处理24 h时表达量分别下调为对照的12％和40％,并在处理周期内总体上维持低于对照的水平.亚细胞定位分析表明,ScMYB52-1-GFP重组蛋白定位在烟草叶肉细胞的细胞核中.酵母双杂交自激活活性鉴定结果表明,ScMYB52-1蛋白无自激活活性.以上结果表明ScMYB52-1参与了甘蔗对高盐胁迫的应答,并可能受ABA信号通路的调控,在叶和根中存在差异的调控机制.本研究结果为进一步理解该基因在甘蔗非生物逆境适应过程中的功能及分子调控机制提供了初步的信息.
文献关键词：
甘蔗;MYB转录因子;基因表达;非生物逆境;实时荧光定量PCR
中图分类号：
作者姓名：
林泳许;于庆;冯美嫦;林嘉颖;赵明明;欧秋月;郭晋隆;黄国强
作者机构：
福建师范大学教育学部,福建福州 350007;福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心,福建福州 350002
文献出处：
引用格式：
[1]林泳许;于庆;冯美嫦;林嘉颖;赵明明;欧秋月;郭晋隆;黄国强-.甘蔗MYB转录因子基因ScMYB52-1的克隆及表达特性分析)[J].热带作物学报,2022(07):1328-1337
A类：
ScMYB52,AtMYB52,AtMYB54
B类：
表达特性,生物学过程,非生物逆境,Saccharum,spp,逆境响应,RACE,甘蔗品种,ROC22,R2R3,生物信息学分析,cDNA,bp,开放阅读框,ORF,翻译区,区长,分子量,kDa,结构域,拟南芥,进化树,亲缘关系,多序列比对,比对分析,高度一致,三级结构,组培苗,PEG,不敏,ABA,NaCl,别下,调为,亚细胞定位,定位分析,GFP,重组蛋白,蛋白定位,烟草,草叶,叶肉细胞,细胞核,酵母双杂交,自激,活活,活性鉴定,高盐胁迫,叶和根,逆境适应,适应过程,分子调控机制
AB值：
0.295808
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