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谷子mTERF基因家族全基因组鉴定与分析
文献摘要：
[目的]线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factor,mTERF)是由核基因编码调控细胞器基因表达的一类蛋白.本研究从谷子基因组中鉴定了mTERF基因家族成员,为探究该基因家族在谷子生长发育中的生物学功能提供理论基础.[方法]通过生物信息学方法分析该家族基因的染色体分布、系统发育进化树、保守结构域及基序、顺式作用元件、基因表达及亚细胞定位.[结果]共鉴定到37个谷子mTERF基因家族成员,在染色体上呈不均匀分布,1号染色体上基因数目最多;37个谷子mTERF蛋白都含有保守的mTERF结构域,绝大多数mTERF蛋白中motif按一定的顺序排列,motif1在每个mTERF蛋白上较其它motif保守;该家族含有光、干旱诱导、醇溶蛋白代谢、细胞周期、昼夜节律、黄酮合成响应的顺式元件以及生长素、赤霉素等多种植物激素响应的顺式元件;谷子、玉米及拟南芥的97个mTERF家族的基因可分为6大类;谷子mTERF基因表达具有组织特异性,其中Si9g06960在叶片的表达量最高;该家族蛋白主要在叶绿体及线粒体中有定位信号.[结论]谷子mTERF基因家族可能影响叶绿体及线粒体的形态发育,对谷子的生长及逆境响应等生物学过程发挥着重要的作用,该研究有助于了解谷子mTERF对谷子生长发育及抗逆等生物学过程的意义,为后续基因的研究提供指导.
文献关键词：
谷子;mTERF;全基因组;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
任雪梅;刘浩瑞;南力彰;陈晋杰;韩渊怀
作者机构：
山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷,030801;山西农业大学 农学院,山西 太谷,030801
文献出处：
引用格式：
[1]任雪梅;刘浩瑞;南力彰;陈晋杰;韩渊怀-.谷子mTERF基因家族全基因组鉴定与分析)[J].山西农业大学学报（自然科学版）,2022(02):1-11
A类：
mTERF,Si9g06960
B类：
谷子,基因家族,全基因组鉴定,mitochondrial,transcription,termination,基因编码,细胞器,生物学功能,生物信息学方法,家族基因,系统发育进化树,保守结构域,基序,顺式作用元件,亚细胞定位,不均匀分布,顺序排列,motif1,干旱诱导,醇溶蛋白,蛋白代谢,细胞周期,昼夜节律,黄酮,生长素,赤霉素,植物激素,激素响应,拟南芥,有组织,组织特异性,叶绿体,形态发育,逆境响应,生物学过程,抗逆,表达分析
AB值：
0.268791
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