典型文献
谷子NPR1基因特征及响应禾生指梗霉侵染的表达分析
文献摘要：
病程相关基因1的非表达子(NPR1)是植物抗病信号传导的关键基因,在植物响应病原菌侵染过程中发挥重要作用.为分析谷子NPR1家族基因的特征及响应禾生指梗霉侵染的表达水平,根据已报道的拟南芥、水稻NPR1蛋白序列,利用BLASTP对xiaomi全基因组进行鉴定,利用生物信息学方法进行理化性质分析、进化分析、基因结构分析,利用转录组数据分析谷子NPR1家族基因的组织表达特异性及响应禾生指梗霉胁迫下的表达特征.结果表明,共筛选到谷子NPR1家族基因4个,分别位于第5、8、9号染色体上,依次命名为SiNPR1～SiNPR4,编码475～629个氨基酸,其中,SiNPR1定位于细胞核中,SiNPR2、SiNPR4定位于叶绿体中,SiNPR3定位于质膜且为唯一的疏水蛋白.进化分析发现,谷子与拟南芥、水稻NPR1家族基因可分为3类,其中,SiNPR2和SiNPR4聚为一支,SiNPRs与OsNPRs亲缘关系更近.motif分析中共鉴定到8个motif基序,除SiNPR3仅含有5个保守基序外,其余成员均含8个保守基序,且排列顺序均为motif6、motif2、motif7、motif3、motif4、motif5、motif1、motif8;顺式作用元件分析发现,该家族成员主要含有水杨酸、茉莉酸甲酯、赤霉素等激素元件.组织特异性分析发现,仅SiNPR1在不同时期未成熟种子中特异高表达,其余基因均在不同时期叶片中高表达;转录组分析发现,SiNPR1在受禾生指梗霉侵染的谷子叶片和穗中均上调表达,表明SiNPR1可能在抵御禾生指梗霉侵染方面发挥重要作用.
文献关键词：
谷子;NPR1;禾生指梗霉;转录组;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
刘旭;张诺;徐林;孙卓楠;张宝俊
作者机构：
山西农业大学 植物保护学院,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]刘旭;张诺;徐林;孙卓楠;张宝俊-.谷子NPR1基因特征及响应禾生指梗霉侵染的表达分析)[J].山西农业科学,2022(09):1233-1239
A类：
禾生指梗霉,xiaomi,SiNPR1,SiNPR4,SiNPR2,SiNPR3,SiNPRs,OsNPRs,motif7,motif5,未成熟种子
B类：
谷子,基因特征,表达分析,植物抗病,信号传导,关键基因,病原菌侵染,侵染过程,家族基因,拟南芥,水稻,BLASTP,全基因组,利用生物,生物信息学方法,性质分析,进化分析,基因结构,转录组数据,组织表达,胁迫,表达特征,细胞核,叶绿体,质膜,疏水蛋白,亲缘关系,保守基序,排列顺序,motif6,motif2,motif3,motif4,motif1,motif8,顺式作用元件,水杨酸,茉莉酸甲酯,赤霉素,素元,组织特异性,转录组分析,子叶,表达模式
AB值：
0.267387
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