典型文献
铁皮石斛酸性蔗糖转化酶基因家族鉴定及低温下表达分析
文献摘要：
为了探究DcAI家族基因的生物学特性及其在逆境响应中的潜在功能,基于已公布的铁皮石斛基因组数据,对铁皮石斛DcAI基因家族进行鉴定和生物信息学分析,并用RNA-Seq(转录组测序)技术分析其在低温胁迫下的表达模式.结果表明,DcAI基因家族共有4个成员,其中液泡蔗糖转化酶编码基因和细胞壁蔗糖转化酶编码基因各2个,在数量上与其他物种间的差异较大,存在基因丢失现象.DcAIs具有相似的内含子/外显子结构,且不均匀地分布在染色体上,其蛋白质结构高度保守,具有酸性蔗糖转化酶特有的氨基酸保守基序.DcAIs启动子含有多种顺式作用元件,涉及光响应、胁迫响应、激素响应、发育调节等多种生理生化过程;DcAIs在铁皮石斛不同组织中的表达丰度不同,具有明显的组织表达特异性;DcAIs在低温胁迫下呈现不同的表达模式,以同工酶形式在不同组织中对低温胁迫采取不同的响应机制,推测DcAIs可能通过调节自身基因的表达以提高细胞内可溶性多糖含量,从而增强铁皮石斛对低温的耐受能力.研究结果可为DcAIs基因的利用及铁皮石斛优良种质的分子遗传改良提供参考借鉴.
文献关键词：
铁皮石斛;酸性蔗糖转化酶;基因家族;生物信息学;表达分析;冷胁迫响应
中图分类号：
作者姓名：
刘博婷;唐演儿;李琳;林一帆;李学诗;于白音;刘羽佳
作者机构：
韶关学院英东生物与农业学院,广东韶关512005;广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室(韶关学院),广东韶关512005;韶关市石斛工程技术开发中心,广东韶关512005
文献出处：
引用格式：
[1]刘博婷;唐演儿;李琳;林一帆;李学诗;于白音;刘羽佳-.铁皮石斛酸性蔗糖转化酶基因家族鉴定及低温下表达分析)[J].江苏农业科学,2022(24):33-42
A类：
DcAI,DcAIs
B类：
铁皮石斛,酸性蔗糖转化酶,酶基因,基因家族鉴定,表达分析,家族基因,生物学特性,逆境响应,基因组数据,生物信息学分析,Seq,转录组测序,低温胁迫,表达模式,液泡,编码基因,细胞壁,种间,内含子,外显子,蛋白质结构,保守基序,启动子,顺式作用元件,光响应,激素响应,发育调节,生理生化,不同组织,组织表达,达特,同工酶,响应机制,节自,多糖含量,耐受能力,优良种质,分子遗传,遗传改良,冷胁迫响应
AB值：
0.249394
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