典型文献
普通烟草CCCH类锌指蛋白家族的全基因组鉴定和表达分析
文献摘要:
为了解烟草CCCH类锌指蛋白家族特性,利用拟南芥CCCH类锌指蛋白结构域比对烟草基因组数据库,共鉴定到86个CCCH类锌指蛋白基因家族成员,并对其进行蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布、基序、启动子顺式作用元件、基因表达模式分析以及对激素的响应分析.结果显示,烟草CCCH类锌指蛋白家族86个基因中37个成员分布在17条不同的染色体上;基序分析显示,该家族所有成员均含有C-X7/8-C-X5-C3-H基序,除此之外,在烟草中也发现了一些新的CCCH基序,如C-X6-C-X4-C-X3-H等;系统进化树显示,86个CCCH类锌指蛋白中的51个成员分为9个亚家族;启动子分析表明,NtC3H-39基因含有多个应激响应元件和激素响应元件.基因表达模式和激素响应分析表明,NtC3H-39具有明显的组织表达特异性,并对激素和干旱胁迫具有明显响应.
文献关键词:
烟草;CCCH类锌指蛋白基因家族;NtC3H-39;胁迫应答;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
唐春闺;邓兆龙;刘琼;金维环;向世鹏;谢鹏飞;郭红祥;刘卫群
作者机构:
湖南省烟草公司长沙市公司,湖南长沙410011;河南农业大学生命科学学院,河南郑州450002
文献出处:
引用格式:
[1]唐春闺;邓兆龙;刘琼;金维环;向世鹏;谢鹏飞;郭红祥;刘卫群-.普通烟草CCCH类锌指蛋白家族的全基因组鉴定和表达分析)[J].河南农业科学,2022(04):48-58
A类:
家族特性,NtC3H
B类:
普通烟草,CCCH,锌指蛋白家族,全基因组鉴定,表达分析,拟南芥,蛋白结构域,基因组数据,基因家族,基序,顺式作用元件,基因表达模式,表达模式分析,响应分析,X7,X5,除此之外,X6,X4,X3,系统进化树,亚家族,启动子分析,应激响应,响应元,激素响应,组织表达,达特,干旱胁迫,胁迫应答
AB值:
0.261044
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