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典型文献
全基因组水平蒺藜苜蓿CPP基因家族的鉴定及表达模式分析
文献摘要:
CPP(cysteine-rich polycomb-like protein)基因家族是一类小转录因子,广泛存在于除酵母与原核生物外的各种生物体中,在植物生长发育及响应胁迫过程中具有重要作用.截至目前,CPP基因家族已在多个物种中被鉴定和研究,但在豆科模式植物蒺藜苜蓿中还未见报道.本研究采用生物信息学的方法,在蒺藜苜蓿中共鉴定出9个CPP基因.通过与3个物种CPP基因的蛋白序列构建系统发育树,将CPP基因分为3类,MtCPP成员与大豆的亲缘关系更接近.保守结构域分析表明MtCPP转录因子都具有1~2个CXC保守结构域.染色体定位分析得出,9个CPP基因分布在6条染色体上,并鉴定出2对旁系同源基因,均来源于片段重复事件.通过基因芯片技术检测MtCPP基因的表达模式结果显示,MtCPP基因的表达具有一定的时空特异性.MtCPP基因启动子中含有大量与激素以及胁迫相关的顺式作用元件,并且MtCPP2、MtCPP5、MtCPP6和MtCPP7基因具有响应干旱的表达特征,MtCPP2和MtCPP8基因具有响应盐胁迫的功能.该研究可为后期深入解析MtCPP基因家族功能和筛选参与苜蓿抗逆的MtCPP基因奠定基础.
文献关键词:
CPP;转录因子;蒺藜苜蓿;表达分析;非生物胁迫
作者姓名:
田骄阳;王秋霞;郑淑文;刘文献
作者机构:
兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室,兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室,兰州大学草地农业教育部工程研究中心,兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020
文献出处:
引用格式:
[1]田骄阳;王秋霞;郑淑文;刘文献-.全基因组水平蒺藜苜蓿CPP基因家族的鉴定及表达模式分析)[J].草业学报,2022(07):111-121
A类:
MtCPP,MtCPP2,MtCPP5,MtCPP6,MtCPP7,MtCPP8
B类:
全基因组,蒺藜苜蓿,基因家族,表达模式分析,cysteine,rich,polycomb,like,protein,酵母,原核生物,物外,生物体,植物生长发育,豆科,见报,建系,系统发育树,大豆,亲缘关系,保守结构域,CXC,染色体定位,定位分析,基因分布,旁系,同源基因,基因芯片技术,时空特异性,基因启动子,顺式作用元件,表达特征,盐胁迫,抗逆,表达分析,非生物胁迫
AB值:
0.256026
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