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紫花苜蓿ADK基因家族成员鉴定与分析
文献摘要:
腺苷酸激酶 (ADK) 是广泛分布于动植物体内维持细胞能量动态平衡的关键酶,在调控植物生长发育和逆境应答等过程中发挥重要功能.基于紫花苜蓿(Medicago sativa)基因组数据,在全基因组水平对ADK基因进行鉴定,通过生物信息学方法分析了MsADK基因的理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用原件、系统进化关系、蛋白二级和三级结构,以及在不同组织和非生物胁迫下的表达模式.结果表明,紫花苜蓿MsADK家族有10个成员,分布于7条染色体上,3对基因为片段复制;编码区序列长度627~1515 bp,平均长度为768 bp;外显子数目以3~6个居多;蛋白表现为亲水性,亚细胞定位多样,主要位于细胞质;系统进化分析表明MsADK在不同物种间高度保守,与豆科植物亲缘关系更近;顺式作用元件的预测结果表明,MsADK启动子区存在许多与激素、胁迫和光响应有关的反应元件.在不同组织和非生物胁迫下的表达模式表明,MsADK基因在茎中的表达丰度更高;在脱落酸(ABA)、干旱和盐胁迫条件下,除MsADK1、MsADK3和MsADK8上调表达外,其余基因随着胁迫时间的延长均下调表达.但是在低温胁迫下,除MsADK2、MsADK5下调表达外,其他成员均上调表达.研究结果表明,MsADK基因在不同胁迫条件下,存在正向和负向两种调控模式.研究结果将为基于ADK基因遗传改良紫花苜蓿提供候选基因和理论依据.
文献关键词:
ADK基因;生物信息学;基因复制;系统进化;生长发育;表达模式;非生物胁迫
中图分类号:
作者姓名:
王仪明;雷艳芳;徐俊山;魏臻武;魏佳;闵学阳
作者机构:
上海鼎赢农业有限公司, 上海 202178;光明食品(集团)有限公司, 上海 200040;扬州大学动物科学与技术学院, 江苏 扬州 225009
文献出处:
引用格式:
[1]王仪明;雷艳芳;徐俊山;魏臻武;魏佳;闵学阳-.紫花苜蓿ADK基因家族成员鉴定与分析)[J].草业科学,2022(09):1803-1814
A类:
MsADK,MsADK1,MsADK3,MsADK8,MsADK2,MsADK5
B类:
紫花苜蓿,基因家族,成员鉴定,腺苷酸,动植物,植物体,动态平衡,关键酶,植物生长发育,逆境应答,重要功能,Medicago,sativa,基因组数据,全基因组,生物信息学方法,基因结构,染色体定位,原件,进化关系,三级结构,不同组织,非生物胁迫,表达模式,编码区,bp,平均长度,外显子,亲水性,亚细胞定位,细胞质,系统进化分析,种间,豆科植物,亲缘关系,顺式作用元件,启动子区,光响应,反应元件,脱落酸,ABA,盐胁迫,胁迫条件,低温胁迫,调控模式,基因遗传,遗传改良,候选基因,基因复制
AB值:
0.288939
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