典型文献
谷子HSP90基因家族鉴定及干旱胁迫下表达分析
文献摘要:
热激蛋白90(heat shock proteins 90,HSP90)是广泛存在于植物中的一种高度保守的细胞伴侣蛋白家族,参与调节和维持各种蛋白质的构象,在植物的生物和非生物胁迫应激反应中起着重要作用.为探讨谷子HSP90基因家族(SiHSP90s)在干旱胁迫下的潜在抗旱功能,对SiHSP90s进行鉴定,并分析其在干旱胁迫下的表达情况.共鉴定出9个SiHSP90基因分别位于谷子5条染色体上.理化性质分析显示SiHSP90s蛋白长度为403~817个氨基酸,分子量为46.1~92.7 ku.系统进化分析显示SiHSP90s分为Ⅰ型和Ⅱ型2个亚家族.基因结构与蛋白基序分析显示,Ⅰ型和Ⅱ型亚族成员的外显子数量分别在2~3个和12~20个之间,且均含有保守的HATPase c(PF02518)和HSP90(PF00183)结构域.顺式元件分析表明,SiHSP90s基因可以应对不同的非生物胁迫.qRT-PCR结果表明,干旱胁迫下SiHSP90.2和SiHSP90.3转录水平极显著上调.这些结果为阐明SiHSP90家族的进化关系以及进一步研究SiHSP90基因的功能特性提供了有价值的信息.
文献关键词:
热激蛋白90;基因家族;干旱胁迫;表达分析;谷子
中图分类号:
作者姓名:
顾鹏鹏;马鑫磊;姚锐;高慧;林小虎
作者机构:
河北省作物逆境生物学重点实验室/河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛066004
文献出处:
引用格式:
[1]顾鹏鹏;马鑫磊;姚锐;高慧;林小虎-.谷子HSP90基因家族鉴定及干旱胁迫下表达分析)[J].江苏农业科学,2022(06):45-52
A类:
SiHSP90s,SiHSP90,PF02518,PF00183
B类:
谷子,基因家族鉴定,干旱胁迫,表达分析,热激蛋白,heat,shock,proteins,伴侣蛋白,白家,种蛋,构象,非生物胁迫,应激反应,抗旱,性质分析,分子量,ku,系统进化分析,亚家族,基因结构,基序,外显子,HATPase,结构域,顺式,qRT,转录水平,进化关系,功能特性
AB值:
0.260051
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