典型文献
芫荽NPR1-like家族全基因组鉴定及分析
文献摘要：
为研究芫荽NPR1-like基因家族的进化和功能,利用生物信息学手段,从芫荽全基因组中鉴定出7个NPR1-like基因,将其命名为CsNPR1～7,并对其理化性质、系统发生关系、保守结构域、基因结构、启动子区顺式作用元件和表达模式进行预测和分析.结果表明,芫荽7个NPRl-like基因家族成员在进化上分为Clade Ⅰ、Clade Ⅱ和Clade Ⅲ共3个分支,序列中有典型的BTB/POZ和锚蛋白重复结构域,含有1～3个内含子.芫荽NPRs不仅在蛋白序列中涉及构象变化、核定位及水杨酸(SA)结合等核心功能位点与拟南芥高度保守,而且在基因结构上也与拟南芥NPRs相似,暗示着二者可能具有类似的功能.CsNPRs基因启动子区域含有与激素响应、逆境胁迫和植物生长发育相关的顺式作用元件.基因表达分析结果显示,CsNPRs的表达部位和时期各不相同,暗示着芫荽NPR1-like基因家族成员可能在调控芫荽不同组织和不同时期生长发育过程中发挥不同作用.
文献关键词：
芫荽;NPR1-like;基因家族;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
王葆生;庞杰;廉勇;刘晓蕊;扈顺;刘湘萍
作者机构：
内蒙古自治区农牧业科学院蔬菜花卉研究所,内蒙古呼和浩特010031
文献出处：
引用格式：
[1]王葆生;庞杰;廉勇;刘晓蕊;扈顺;刘湘萍-.芫荽NPR1-like家族全基因组鉴定及分析)[J].江苏农业科学,2022(13):103-111
A类：
CsNPR1,NPRl,NPRs,CsNPRs
B类：
芫荽,like,全基因组鉴定,基因家族,利用生物,系统发生关系,保守结构域,基因结构,顺式作用元件,表达模式,Clade,BTB,POZ,锚蛋白,内含子,构象变化,核定,水杨酸,SA,核心功能,拟南芥,暗示着,基因启动子区,启动子区域,激素响应,逆境胁迫,植物生长发育,基因表达分析,各不相同,不同组织
AB值：
0.26482
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