典型文献
甘草AQPs基因家族的鉴定及表达分析
文献摘要：
水通道蛋白(AQPs)定位于质膜,在调控植物水分平衡中具有重要意义.甘草(Glycyrrhiza uralensis)是常用大宗药材,多生长于干旱环境,水分平衡对其生长影响极大.为了解AQPs在甘草中的作用,本研究以生物信息学方法对甘草水通道蛋白基因(GuAQPs)家族成员进行分析,结合转录组数据和qRT-PCR分析GuAQPs在非生物胁迫下的表达情况.结果表明,甘草基因家族中共有43个GuAQPs基因,主要分为PIPs、TIPs、NIPs和SIPs 4个亚家族,均含有MIP结构域和NAP基序、Ar/R过滤器及Froger位点,二级结构以无规则卷曲为主.GuAQPs基因启动子区含有响应激素、逆境的顺式作用元件.qRT-PCR结果显示GuTIP2;3在干旱处理或ABA处理后叶和根中都显著上调表达(P＜0.05);GuSIPI;4和GuNIP6;1在盐胁迫后叶和根中都显著上调表达(P＜0.05),而施加盐胁迫后GuTIP4;1在根中显著下调表达(P＜0.05);低温处理下GuNIP6;1和GuSIPl;2在根和叶中都显著下调表达(P＜0.05).通过甘草全基因组中的水通道蛋白基因的鉴定和表达分析,初步了解不同逆境胁迫对甘草AQPs的影响,为进一步研究甘草生长发育的分子机理提供理论基础.
文献关键词：
药用植物;水通道蛋白;生物信息学;系统进化分析;非生物胁迫;激素处理;基因表达模式
中图分类号：
作者姓名：
张亚丽;王楠;张岗;何懿菡;颜永刚;高静
作者机构：
陕西中医药大学药学院,陕西西安712046;陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育),陕西咸阳712083
文献出处：
引用格式：
[1]张亚丽;王楠;张岗;何懿菡;颜永刚;高静-.甘草AQPs基因家族的鉴定及表达分析)[J].草业科学,2022(10):2127-2144
A类：
GuAQPs,TIPs,SIPs,Froger,GuTIP2,GuSIPI,GuNIP6,GuTIP4,GuSIPl
B类：
甘草,基因家族,表达分析,水通道蛋白,质膜,水分平衡,Glycyrrhiza,uralensis,大宗,多生,干旱环境,生长影响,生物信息学方法,转录组数据,qRT,非生物胁迫,PIPs,NIPs,亚家族,MIP,结构域,NAP,基序,Ar,过滤器,二级结构,无规则,卷曲,基因启动子区,顺式作用元件,旱处理,ABA,后叶,叶和根,盐胁迫,加盐,低温处理,全基因组,逆境胁迫,分子机理,药用植物,系统进化分析,激素处理,基因表达模式
AB值：
0.304638
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