典型文献
玉米LEC1基因家族的鉴定与生物信息学分析
文献摘要：
LEC基因家族包含LEC1和LEC2,参与植物的生长发育及储藏物质的积累.LEC1(Leafy Cotyledon 1)是NF-YB9蛋白家族的成员,编码了CCAAT-box结合转录因子HAP3(Heme activated protein 3)亚单位.利用生物信息学方法,获得了16个玉米LEC1基因.分析发现,ZmLEC1蛋白大部分都是酸性的不稳定亲水蛋白,含有1个保守结构域CBFD_NFYB_HMF及10个保守基序.通过与拟南芥LEC1基因和水稻LEC1基因的聚类分析,将玉米LEC1基因家族分为4类:ClassⅠ、ClassⅡ、ClassⅢ、ClassⅣ.经RNA-seq等分析发现,玉米LEC1家族基因具有组织特异性,响应非生物胁迫.启动子分析发现,玉米LEC1基因启动子上含有响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件.
文献关键词：
玉米;LEC1基因家族;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
刘畅畅;黄敏
作者机构：
长江大学生命科学学院,湖北 荆州 434025
文献出处：
引用格式：
[1]刘畅畅;黄敏-.玉米LEC1基因家族的鉴定与生物信息学分析)[J].寒旱农业科学,2022(01):31-37
A类：
LEC2,Leafy,Cotyledon,YB9,HAP3,ZmLEC1,CBFD
B类：
基因家族,生物信息学分析,储藏,白家,CCAAT,box,Heme,activated,protein,亚单位,利用生物,生物信息学方法,定亲,亲水,保守结构域,NFYB,HMF,保守基序,拟南芥,水稻,Class,seq,家族基因,有组织,组织特异性,非生物胁迫,启动子分析,基因启动子,顺式作用元件
AB值：
0.276017
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