典型文献
大豆干旱响应GRAS基因筛选及GmGRAS27的生物信息学和逆境表达分析
文献摘要：
GRAS转录因子在植物抵抗非生物胁迫过程中发挥了重要作用,为了研究大豆GRAS基因在干旱胁迫中的响应,以挖掘大豆GRAS转录因子在干旱等非生物胁迫响应中的功能和分子机制提供分子基础,本研究利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选响应干旱胁迫的大豆GRAS基因,利用PlantCARE分析其启动子中的顺式作用元件.进一步对在营养生长时期(V6)和盛花期(R2)均受到干旱胁迫强烈诱导的GRAS基因GmGRAS27进行克隆和生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR方法分析干旱、盐和ABA胁迫下GmGRAS27基因的表达情况.结果显示:从大豆117个GRAS基因中筛选出10个响应干旱胁迫的GRAS基因,其启动子序列中均至少含有1个激素或逆境胁迫应答相关元件,GmGRAS27(Glyma.06G265500)基因的启动子同时含有ABRE应答元件和MYB/MYC结合元件.GmGRAS27在V6和R2期均受到干旱胁迫的强烈诱导,其编码的蛋白质GmGRAS27含有典型的GRAS基因家族结构域,高级结构以α?螺旋和无规则卷曲为主.实时荧光定量PCR分析显示GmGRAS27不仅受到干旱胁迫的强烈诱导,还受到盐胁迫和ABA的正向调控.推测GmGRAS27不仅是大豆干旱胁迫的重要候选基因也可能响应其他非生物胁迫.
文献关键词：
大豆;干旱;GRAS;GmGRAS27;生物信息学;逆境胁迫;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
刘薇;张彦威;王玉斌;李伟;徐冉;王彩洁;张礼凤
作者机构：
山东省农业科学院 作物研究所/山东省特色作物工程实验室,山东 济南250100
文献出处：
引用格式：
[1]刘薇;张彦威;王玉斌;李伟;徐冉;王彩洁;张礼凤-.大豆干旱响应GRAS基因筛选及GmGRAS27的生物信息学和逆境表达分析)[J].大豆科学,2022(01):36-42
A类：
GmGRAS27,06G265500,其他非生物胁迫
B类：
大豆,豆干,干旱响应,基因筛选,表达分析,抗非,干旱胁迫,胁迫响应,分子基础,研究利用,基因表达综合数据库,Gene,Expression,Omnibus,GEO,PlantCARE,顺式作用元件,营养生长,生长时期,V6,盛花期,生物信息学分析,ABA,启动子序列,逆境胁迫应答,关元,Glyma,ABRE,MYB,MYC,基因家族,结构域,无规则,卷曲,盐胁迫,重要候选基因
AB值：
0.226626
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