典型文献
小麦DA1基因家族成员的鉴定及其表达谱分析
文献摘要：
泛素受体DA1在控制种子和器官大小上发挥着重要作用.本研究以中国春小麦为材料,采用生物信息学的方法对小麦DA1基因家族成员进行了全基因组鉴定和分析,共鉴定到12个小麦DA1同源基因(TaDA1s),分别位于2B、2D、4A、4B、4D、5A、5B和5D染色体上,亚细胞定位预测结果表明其位于细胞核中.系统进化分析发现,TaDA1s可分为TaDA1、TaDAR1和TaDAR2三类.除TaDA1-2D1编码的蛋白只含有DA1-like结构域外,其他成员编码的蛋白均含有DA1-like、UIM和LIM结构域.启动子序列分析发现,TaDA1s的启动子区含有较多的响应激素、逆境以及与生长发育相关的顺式作用元件.通过公共的转录组数据和qRT-PCR试验验证,发现TaDA1s在不同组织中都有表达,在籽粒发育过程中,不同的小麦DA1基因呈现不同的表达模式,暗示存在基因功能分化现象;脱落酸(ABA)能够抑制TaDA1s的表达;在低温和盐胁迫条件下,TaDA1s基因表达有明显的差异.酵母双杂交和荧光素酶互补试验发现,TaDA1-2B、TaDAR1-5 A和TaGW2存在转录自激活现象,且TaDAR1-5A与TaGW2有微弱的互作效应.本研究结果为进一步探究DA1基因家族在小麦中的生物学功能奠定了基础.
文献关键词：
小麦;DA1基因家族;生物信息学;基因表达;蛋白互作
中图分类号：
作者姓名：
宫盼盼;陈浩;宋成祥;许书豪;张杏;茆海亮
作者机构：
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室/华中农业大学植物科学技术学院,湖北武汉430070
文献出处：
引用格式：
[1]宫盼盼;陈浩;宋成祥;许书豪;张杏;茆海亮-.小麦DA1基因家族成员的鉴定及其表达谱分析)[J].麦类作物学报,2022(06):659-668
A类：
TaDA1s,TaDA1,TaDAR1,TaDAR2,2D1
B类：
基因家族,表达谱分析,泛素,制种,春小麦,全基因组鉴定,同源基因,2B,4A,4B,4D,5A,5B,5D,亚细胞定位,定位预测,细胞核,系统进化分析,like,结构域,域外,UIM,LIM,启动子序列,序列分析,启动子区,逆境,顺式作用元件,公共的,转录组数据,qRT,不同组织,籽粒发育,表达模式,暗示,基因功能,分化现象,脱落酸,ABA,盐胁迫,胁迫条件,酵母双杂交,荧光素酶,TaGW2,自激,活现,微弱,互作效应,生物学功能,蛋白互作
AB值：
0.317435
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