典型文献
烟草早花相关基因ELF的生物信息学分析
文献摘要:
普通烟草早花相关基因在生物胁迫和非生物胁迫条件下对烟草开花调控发挥着重要作用,但关于烟草早花相关基因和蛋白质的研究尚少.本研究利用生物信息学的方法,对普通烟草与番茄、辣椒、拟南芥和水稻等植物中早花相关ELF蛋白质进行理化性质预测、多序列比对、系统进化树构建、蛋白二级和三级结构以及组织表达特征分析.结果表明:9条烟草早花相关的ELF蛋白质均无跨膜结构和信号肽序列,为亲水性非分泌蛋白,且属于膜外蛋白;普通烟草ELF蛋白二级结构中α-螺旋的比例为61.82%,结构域主要由β-转角连接2个α-螺旋组成.烟草ELF基因在进化过程中保守性相对较强,结构变化不大,与辣椒植物同源关系较近.NtELF42、NtELF43、NtELF44和NtELF46具有的磷酸化位点较多,推测在开花过程中可能具有信号转导的作用,调控花芽组织分化等功能.烟草ELF基因具有组织表达特异性,暗示了这些蛋白参与了不同组织的生长发育阶段.
文献关键词:
烟草;早花相关基因;ELF4结构分析;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
吴俊林;郭传滨;李昂;姜山;肖金胜;刘哲;王瑞云;周权;贾峰
作者机构:
河南省驻马店市烟草公司泌阳县分公司,河南泌阳 463700;湖北中烟工业有限责任公司襄阳卷烟厂,湖北襄阳 441000;河南工业大学生物工程学院,河南郑州 450001
文献出处:
引用格式:
[1]吴俊林;郭传滨;李昂;姜山;肖金胜;刘哲;王瑞云;周权;贾峰-.烟草早花相关基因ELF的生物信息学分析)[J].现代农业科技,2022(12):1-5,15
A类:
早花相关基因,NtELF42,NtELF43,NtELF44,NtELF46
B类:
生物信息学分析,普通烟草,非生物胁迫,胁迫条件,开花调控,质的研究,研究利用,利用生物,番茄,辣椒,拟南芥,水稻,多序列比对,系统进化树,进化树构建,三级结构,组织表达,表达特征,条烟,膜结构,信号肽,肽序列,亲水性,非分,分泌蛋白,蛋白二级结构,结构域,保守性,磷酸化,信号转导,控花,花芽,组织分化,有组织,暗示,白参,不同组织,发育阶段,表达分析
AB值:
0.314172
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