典型文献
大豆TGL基因家族全基因组鉴定及高盐胁迫响应研究
文献摘要:
三酰甘油脂肪酶(TGL)是甘油三脂分解代谢的主要酶,TGLs能水解参与植物生长发育和非生物胁迫反应的长链脂肪酸甘油三酯(TAG).为研究大豆TGL基因家族的基因成员及其对高盐胁迫的响应,本研究通过同源比对方法在大豆中鉴定GmTGLs基因并对其进行生物信息学分析,根据RNA?seq数据库并采用荧光定量PCR方法分析盐胁迫下基因的表达量差异,并对主要盐胁迫响应基因进行生物信息学分析.结果显示:共从大豆中鉴定出15个GmTGLs基因,不均匀地分布在11条染色体上,其编码氨基酸序列为392~701 aa.这些GmTGLs均有保守结构域Abhydro_lipase(PF04083).启动子顺式作用元件分析表明,GmTGLs的启动子包含光响应顺式元件,激素响应元件及ARE、LTR、TC?rich repeats和MBS等胁迫响应元件.转录组数据分析表明GmTGL3、GmTGL14基因在所有组织中均有表达,GmTGL3、GmTGL14、GmTGL2和GmTGL6基因在盐胁迫后表达上调,GmTGL2和GmTGL3基因的表达变化最明显.荧光定量PCR分析结果表明GmTGL2和GmTGL3可能分别主要在盐胁迫的后期和前期参与响应,进一步证实TGL基因家族参与了大豆对盐胁迫的反应过程.
文献关键词:
大豆;三酰基甘油脂肪酶;生物信息学分析;高盐胁迫;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
王晓丽;王敏;岳爱琴;赵晋忠;王利祥;张永坡;高春艳;杜维俊
作者机构:
山西农业大学 农学院,山西 太谷030800;山西农业大学 基础部,山西 太谷030800
文献出处:
引用格式:
[1]王晓丽;王敏;岳爱琴;赵晋忠;王利祥;张永坡;高春艳;杜维俊-.大豆TGL基因家族全基因组鉴定及高盐胁迫响应研究)[J].大豆科学,2022(01):12-19
A类:
TGL,TGLs,GmTGLs,Abhydro,PF04083,GmTGL3,GmTGL14,GmTGL2,GmTGL6,三酰基甘油脂肪酶
B类:
大豆,基因家族,全基因组鉴定,高盐胁迫,胁迫响应,响应研究,三酰甘油,甘油三脂,分解代谢,植物生长发育,非生物胁迫,胁迫反应,长链脂肪酸,甘油三酯,TAG,同源比对,比对方法,生物信息学分析,seq,响应基因,氨基酸序列,aa,保守结构域,lipase,启动子,顺式作用元件,光响应,激素响应,响应元,ARE,LTR,rich,repeats,MBS,转录组数据,有组织,表达变化,家族参与,反应过程,表达分析
AB值:
0.254194
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。