典型文献
大豆CAT基因家族生物信息学分析及非生物逆境胁迫响应研究
文献摘要：
过氧化氢酶(catalase,CAT)是一种清除需氧生物体中羟基自由基的酶,能减轻氧化伤害.为探究大豆CAT家族基因特性及其在逆境响应中的作用,以拟南芥和水稻CATs基因序列为参考序列,利用大豆基因组数据库进行全基因组鉴定,采用生物信息学方法对其蛋白特性、进化关系、亚细胞定位、组织特异性表达情况、共表达基因以及互作蛋白进行预测分析,并采用荧光定量PCR方法对盐、干旱及缺氧胁迫下不同时间和部位的基因表达模式进行分析.结果显示:在大豆基因组中共鉴定到4个CAT家族同源基因GmCAT1/2、GmCAT3、GmCAT4和GmCAT5.大豆CATs均为亲水性非跨膜蛋白,其氨基酸编码序列均为492 aa,分子量为56 736～56 911 Da,均定位于过氧化物酶体中;GmCATs与拟南芥亲缘关系较近,与水稻亲缘关系较远;GmCATs蛋白以a-螺旋和无规则卷曲为主要结构.基因表达模式预测表明,大豆CAT家族成员在叶和开放的花中的表达量较高;互作蛋白预测表明,GmCATs蛋白与谷胱甘肽氧化酶、酰基辅酶A氧化酶蛋白相互作用;基因共表达预测表明,GmCATs基因与植物能量代谢、氧化还原酶及氧化酶等多个途径的相关基因共表达.荧光定量PCR分析表明,在盐、干旱及缺氧胁迫后GmCATs基因表达量升高,且盐和干旱胁迫下根中的响应较叶片更显著.结果表明GmCATs可能参与大豆对这些逆境胁迫的应答反应,可作为大豆非生物胁响应的重要候选基因.
文献关键词：
大豆;过氧化氢酶;基因家族;表达量;非生物胁迫
中图分类号：
作者姓名：
董璐;杨春洪;陈林;宋丽
作者机构：
扬州大学农业科技发展研究院/教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室/粮食作物现代产业技术协同创新中心,江苏扬州225009
文献出处：
引用格式：
[1]董璐;杨春洪;陈林;宋丽-.大豆CAT基因家族生物信息学分析及非生物逆境胁迫响应研究)[J].大豆科学,2022(06):663-671
A类：
CATs,GmCAT1,GmCAT3,GmCAT4,GmCAT5,GmCATs
B类：
大豆,基因家族,生物信息学分析,非生物逆境胁迫,逆境胁迫响应,响应研究,过氧化氢酶,catalase,需氧,生物体,羟基自由基,氧化伤害,家族基因,基因特性,逆境响应,拟南芥,水稻,基因序列,参考序列,基因组数据,全基因组鉴定,生物信息学方法,蛋白特性,进化关系,亚细胞定位,组织特异性,特异性表达,共表达基因,互作蛋白,预测分析,基因表达模式,同源基因,亲水性,跨膜蛋白,编码序列,aa,分子量,Da,过氧化物酶体,亲缘关系,较远,无规则,卷曲,主要结构,谷胱甘肽,酰基,基辅,辅酶,蛋白相互作用,能量代谢,氧化还原酶,基因表达量,干旱胁迫,应答反应,重要候选基因,非生物胁迫
AB值：
0.309317
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
