以普通丝瓜[Luffa cylindrica(L.)Roem.]为试验材料,基于其全基因组,对生长素酰胺合成酶基因(gretchen hagen 3,GH3)家族成员进行鉴定和生物信息学分析,并分析其在普通丝瓜长果品种、短果品种中的表达情况.结果表明,普通丝瓜全基因组中共存在14个GH3基因家族成员,暂命名为LcGH3.1～LcGH3.14,蛋白序列长度为515～843aa,相对分子量在58.366～96.406 ku之间,LcGH3.8、LcGH3.14为碱性蛋白,其他LcGH3蛋白均为酸性蛋白.LcGH3.1为稳定蛋白,其他LcGH3均为不稳定蛋白.14个LcGH3蛋白均是亲水蛋白,其中LcGH3蛋白主要含有10个基序(Motif),14个LcGH3蛋白均含有Motif 1、Motif 4、Motif5、Motif6、Motif7和Motif 9保守基序.系统进化树分析结果表明,14个LcGH3蛋白聚类在GroupⅡ、GroupⅢ2类.在普通丝瓜长果品种、短果品种商品果中,共有6个GH3基因家族成员存在差异表达,其中Lc GH3.1、Lc GH3.2、Lc GH3.5在短果品种中的相对表达量高于长果品种,Lc GH3.8、Lc GH3.12、Lc GH3.13在短果品种中的相对表达量低于长果品种.推测Lc GH3基因家族与普通丝瓜果实发育相关,且与果长密切相关.

普通丝瓜;GH3家族;生物信息学分析;表达分析

曾美娟;刘建汀;李祖亮;陈敏氡;叶新如;王彬;朱海生;温庆放

福建省蔬菜遗传育种重点实验室/福建省农业科学院作物研究所/福建省蔬菜工程技术研究中心,福建福州350013;福建省农业科学院农业生物资源研究所,福建福州350003

江苏农业科学

[1]曾美娟;刘建汀;李祖亮;陈敏氡;叶新如;王彬;朱海生;温庆放-.普通丝瓜GH3基因家族全基因组鉴定及表达分析)[J].江苏农业科学,2022(18):82-87

Luffa,gretchen,LcGH3,843aa,Motif5,Motif6,Motif7

普通丝瓜,基因家族,全基因组鉴定,表达分析,cylindrica,Roem,生长素,胺合成酶,合成酶基,酶基因,hagen,生物信息学分析,果品,相对分子量,ku,亲水,保守基序,系统进化树分析,Group,差异表达,相对表达量,瓜果,果实发育

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