典型文献
腐霉根腐病抗性候选基因GsDYRK2研究及大豆DYRK基因生物信息学分析
文献摘要：
为挖掘大豆腐霉根腐病抗性基因,对野生大豆腐霉根腐病抗性候选基因—双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶基因GsDYRK2进行研究,在大豆全基因组信息中比对该基因的同源基因家族并进行初步生物信息学分析,进一步对18份野生大豆材料接种大豆腐霉根腐病病菌并进行鉴定和基因实时表达检测,分析GsDYRK2表达量与野生大豆资源腐霉根腐病抗性的关系.结果表明:GsDYRK2与GmDYRK2序列相似度最高为98.21％,由722个氨基酸残基组成,分子质量为82 573.92 Da,等电点为4.63,脂肪系数为75.18,不稳定系数为49.01,为不稳定蛋白,且为亲水性蛋白.大豆DYRK家族成员编码的蛋白质序列长度为409～1 179 aa,分子量为46 356.53～132 314.75 Da,理论等电点为4.63～8.66,不稳定系数为34.88～51.26,脂肪系数为70.90～87.01.GsDYRK2蛋白序列仅含PKc_DYRK_like 一个一级结构域.二级结构类型及含量为:无规卷曲(48.06％)＞α螺旋(36.7％)＞延伸链(11.91％)＞β转角(3.32％).大豆DYRK家族可分为4个亚家族,分别为Yat、DYRK1、DYRK2和DYRKP.GsDYRK2和GmDYRK2均定位于细胞核,GmDYRK7定位于细胞质,其它大豆DYRK蛋白均定位于细胞核.大豆DYRK基因启动子区域主要有18种顺式作用元件,可能与激素信号调控及非生物胁迫相关.经腐霉根腐病抗性鉴定,18份野生大豆中,1级抗病材料1份,2级抗病材料12份,3级抗病材料5份;qRT-PCR检测结果显示,GsDYRK2基因的表达量与野生大豆腐霉根腐病抗性有明显的正相关性.研究结果说明GsDYRK基因的表达量可作为抗腐霉根腐病野生大豆资源辅助筛选的手段之一.
文献关键词：
GsDYRK2;大豆DYRK基因;生物信息学分析;野生大豆;腐霉根腐病;抗性种质筛选
中图分类号：
作者姓名：
刘建新;郭新宇;马乐;杨光;毕影东;樊超;刘淼;张忠林
作者机构：
黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所/黑龙江省寒地野生大豆资源利用工程技术研究中心,黑龙江哈尔滨150086;哈尔滨工程大学绿化中心,黑龙江哈尔滨150001;东北林业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150040;黑龙江省林业科学院伊春分院,黑龙江伊春153000
文献出处：
引用格式：
[1]刘建新;郭新宇;马乐;杨光;毕影东;樊超;刘淼;张忠林-.腐霉根腐病抗性候选基因GsDYRK2研究及大豆DYRK基因生物信息学分析)[J].大豆科学,2022(03):281-287
A类：
腐霉根腐病,GsDYRK2,GmDYRK2,PKc,DYRK1,DYRK2,DYRKP,GmDYRK7,GsDYRK
B类：
根腐病抗性,候选基因,生物信息学分析,豆腐,抗性基因,野生大豆,酪氨酸磷酸化,酶基因,全基因组,基因组信息,中比,同源基因,基因家族,氨基酸残基,基组,分子质量,Da,等电点,不稳定系数,亲水性,蛋白质序列,aa,分子量,like,结构域,二级结构,结构类型,无规,卷曲,亚家族,Yat,细胞核,细胞质,基因启动子区,启动子区域,顺式作用元件,激素信号,信号调控,非生物胁迫,抗性鉴定,抗病材料,qRT,抗性种质筛选
AB值：
0.188051
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