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典型文献
红花SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析
文献摘要:
SPL基因家族是植物特有的转录因子,广泛参与调控植物生长发育,包括花和果实的发育、胁迫响应和次生代谢物的合成等.为探究红花SPL基因家族的进化和功能,本研究基于红花基因组数据库筛选得到21个SPL基因,利用生物信息学方法对其进行分析.结果表明,红花SPL基因家族鉴定得到的21个成员聚类为6个亚家族,同一个亚家族成员具有相似的基因结构和基序,大多数CtSPL蛋白具有1个完整保守的SBP结构域;CtSPL基因启动子区域存在光反应元件,激素应答元件、胁迫响应元件以及和植物生长发育有关的调控元件;miRNA靶位点预测表明有15个CtSPL基因受miR156家族的调控;表达模式分析表明,CtSPL基因呈现组织特异性表达.经茉莉酸甲酯(MeJA)和表油菜素内酯(EBR)处理后,多数CtSPL基因表达量发生变化,推测这些基因参与了红花不同激素的响应.
文献关键词:
红花;SPL基因家族;生物信息学;表达模式;全基因组鉴定
作者姓名:
宋梦瑶;赵乐;董诚明;朱畇昊
作者机构:
河南中医药大学药学院,河南郑州450046;呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州450046
文献出处:
引用格式:
[1]宋梦瑶;赵乐;董诚明;朱畇昊-.红花SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析)[J].江苏农业科学,2022(19):36-43
A类:
CtSPL
B类:
红花,全基因组鉴定,表达分析,植物生长发育,胁迫响应,次生代谢物,基因组数据,选得,利用生物,生物信息学方法,基因家族鉴定,亚家族,同一个,基因结构,基序,SBP,结构域,基因启动子区,启动子区域,光反应,反应元件,激素应答,响应元,miRNA,靶位,点预测,miR156,表达模式分析,组织特异性,特异性表达,茉莉酸甲酯,MeJA,表油菜素内酯,EBR,基因表达量
AB值:
0.307208
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