典型文献
秋茄WRKY基因家族的生物信息学分析
文献摘要:
WRKY蛋白在植物胁迫响应和应答过程中发挥着重要作用.秋茄生长环境恶劣,生存压力使其进化出极强的胁迫响应能力,对各种胁迫的响应是决定秋茄逆境生存的重要因素.目前,关于秋茄WRKY基因家族的研究报道较少.对秋茄WRKY基因家族进行全面的研究,共鉴定出71个KcWRKY基因.结构域分析和进化分析结果表明,KcWRKY基因高度保守且分为3组.保守基序分析结果表明,同组的KcWRKY基因基序分布一致而组间差异显著,说明同组的KcWRKY基因可能具有相似的功能.染色体定位和复制关系表明,71个KcWRKY基因不均匀分布在秋茄基因组18条染色体上,存在4对串联重复基因和大量片段复制基因,这些基因可能在秋茄胁迫响应进化历程中发挥了重要作用.根据KcWRKY基因在不同器官的表达模式推测KcWRKY71参与调节编码线粒体和叶绿体蛋白的胁迫响应,KcWRKY66参与秋茄叶和果衰老的调节.本研究揭示了秋茄WRKY转录因子的基本结构与性质,研究结果能为后续深入研究秋茄WRKY转录因子的功能奠定基础.
文献关键词:
秋茄;WRKY转录因子;基因家族;生物信息分析
中图分类号:
作者姓名:
丁祥青;胡敏杰;向双;赖兴凯;乐易迅;刘仲健;邹双全
作者机构:
福建农林大学园林学院,福建福州,350002;福建师范大学地理科学学院,福建福州350007;福建农林大学林学院,福建福州350002;泉州湾河口湿地自然保护区管理处,福建泉州362000
文献出处:
引用格式:
[1]丁祥青;胡敏杰;向双;赖兴凯;乐易迅;刘仲健;邹双全-.秋茄WRKY基因家族的生物信息学分析)[J].江苏农业科学,2022(14):50-60
A类:
KcWRKY,KcWRKY71,KcWRKY66
B类:
秋茄,基因家族,生物信息学分析,植物胁迫,胁迫响应,生长环境,环境恶劣,生存压力,响应能力,逆境,结构域,进化分析,保守基序,染色体定位,不均匀分布,串联重复基因,复制基因,不同器官,表达模式,叶绿体,衰老,基本结构,结构与性质,生物信息分析
AB值:
0.229307
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。