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大豆OPR基因家族全基因组鉴定与表达分析
文献摘要：
为了揭示大豆12-氧-植物二烯酸还原酶(12-oxo-phytodienoic acid reductase,OPR)家族成员GmOPRs在大豆生长发育中和非生物胁迫下发挥的作用,本研究运用生物信息学方法进行大豆OPR基因家族全基因组鉴定及表达分析.结果显示:大豆基因组中共有12个OPR家族基因成员,分布在8条不同染色体上.系统发育进化分析、基因结构分析和保守基序分析结果显示,GmOPRs可分为两个亚组,含有外显子4～5个,内含子3～5个,GmOPR蛋白之间保守基序分布相似.共线性分析鉴定表明共有4对基因存在共线关系,均为片段复制.GmOPRs启动子区域含有响应厌氧、干旱和低温等非生物胁迫以及JA、ABA等多种激素的顺式作用元件.不同的大豆品种及不同的组织中,GmOPRs的表达模式有差异.GmOPR1、GmOPR4和GmOPR9受干旱胁迫影响后表达量下降,GmOPR7、GmOPR8、GmOPR11和GmOPR12随着盐胁迫影响时间的增长表达量增加,表明GmOPRs基因通过多种表达模式响应干旱和盐胁迫.GmOPRs在系统发育进化和基因结构上比较保守,基因家族数量的扩增主要归因于片段重复.GmOPRs受干旱、盐胁迫等非生物胁迫的影响,表现出不同的表达模式,表明GmOPR基因家族可能在响应非生物胁迫中发挥重要作用.
文献关键词：
大豆;OPR基因家族;非生物胁迫;表达分析;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
王艳微;王敏;王江;张庆祝;解莉楠
作者机构：
东北林业大学生命科学学院/东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨150040;东北林业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150040;东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150040
文献出处：
引用格式：
[1]王艳微;王敏;王江;张庆祝;解莉楠-.大豆OPR基因家族全基因组鉴定与表达分析)[J].大豆科学,2022(02):129-139
A类：
phytodienoic,GmOPRs,GmOPR,GmOPR1,GmOPR4,GmOPR9,GmOPR7,GmOPR8,GmOPR11,GmOPR12
B类：
基因家族,全基因组鉴定,表达分析,烯酸,还原酶,oxo,acid,reductase,非生物胁迫,研究运用,生物信息学方法,家族基因,系统发育,进化分析,基因结构,保守基序,外显子,内含子,白之,共线性分析,分析鉴定,启动子区域,厌氧,JA,ABA,顺式作用元件,大豆品种,表达模式,干旱胁迫,盐胁迫,归因于,生物信息学分析
AB值：
0.18986
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