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小麦DEAD-box基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析
文献摘要：
DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢途径中的关键酶,在RNA代谢过程中调控植株的生长发育和抗逆性.目前,尚未见有人对小麦DEAD-box基因家族进行系统鉴定与分析.为探究小麦DEAD-box基因的功能,本研究以水稻DEAD-box基因家族基因为参照,从小麦全基因组数据库中共鉴定到134个小麦DEAD-box家族基因,并利用生物信息学对其家族成员的理化性质、基因结构、进化树和共线性进行分析.结果表明,小麦DEAD-box蛋白多数为弱碱性蛋白,亚细胞定位分布广泛,核分布最多;小麦与水稻DEAD-box家族基因亲缘性较高,小麦DEAD-box蛋白结构域与核心基序排列有序稳定,高度保守;小麦DEAD-box家族基因在进化过程中可能发生了节段性复制事件,水稻与小麦DEAD-box基因无序共线性连线,说明DEAD-box基因在进化过程中可能存在染色体异位突变.进一步以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和东农冬麦2号(Dn2)为材料,对其转录组库中低温差异表达的7个DEAD-box基因进行qRT-PCR分析,结果表明,这7个基因在不同品种和不同组织中表达量均有差异.Dn1中DEAD-box基因的表达量在-10℃达到峰值,而Dn2中DEAD-box基因的表达量在-25℃达到峰值.
文献关键词：
小麦;DEAD-box;生物信息学;qRT-PCR;低温胁迫
中图分类号：
作者姓名：
齐越;于晶;苍晶;田宇;彭瞰看;王多佳;王政委;任治鹏;梁伊;王晓楠;孟婧
作者机构：
东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150030;东北农业大学农学院,黑龙江哈尔滨150030
文献出处：
引用格式：
[1]齐越;于晶;苍晶;田宇;彭瞰看;王多佳;王政委;任治鹏;梁伊;王晓楠;孟婧-.小麦DEAD-box基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析)[J].麦类作物学报,2022(02):127-138
A类：
Dn1,Dn2
B类：
DEAD,box,基因家族鉴定,表达模式分析,解旋酶,代谢途径,关键酶,代谢过程,植株,抗逆性,未见有人,系统鉴定,水稻,家族基因,全基因组,基因组数据,利用生物,其家,基因结构,进化树,共线性,线性进行,弱碱,亚细胞定位,亲缘性,蛋白结构域,基序,列有,节段性,连线,异位,抗寒,寒冬,冬小麦品种,冬麦,转录组,中低温,差异表达,qRT,不同品种,不同组织,组织中表达,低温胁迫
AB值：
0.279558
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