典型文献
我国诺如病毒GII.6[P7]重组株基因组进化分析
文献摘要：
目的:明确我国诺如病毒暴发GII.6[P7]基因组进化特征和关键位点变异情况。方法:对2018—2021年来自中国诺如病毒暴发监测网络(CaliciNet China)监测获得的46个GII.6[P7]阳性样本进行基因组扩增和测序，同时整合GenBank数据库中的所有ORF1(GII.P7)和ORF2(GII.6)序列，进行贝叶斯进化分析，并利用Simplot软件进行重组分析。结果:根据贝叶斯进化分析，GII.P7聚合酶具有时间进化特性，平均碱基替换速率为2.067×10
－3核苷酸替换/位点/年，与4种不同的VP1基因型发生重组(GII.6、GII.7、GII.14和GII.20)。GII.6型诺如病毒在衣壳区进一步分为GII.6a、GII.6b和GII.6c亚型。本研究46个毒株属于GII.6a亚型，与2015年中国GII.6[P7]参考株NHBGR59为一簇。Simplot分析确定本研究GII.6[P7]毒株重组位点在ORF1-2连接处。VP1氨基酸位点变异主要发生在P1.1末端以及P2区域，与GII.6a亚型参考株相比，受体结合位点均未发生变异。
结论:我国2018—2021年诺如病毒暴发的GII.6[P7]重组株均属于GII.6a[P7]亚型。
文献关键词：
诺如病毒;急性胃肠炎;暴发;基因型;进化
中图分类号：
作者姓名：
韦杏燕;朱曦;章青;孔翔羽;王萌璇;杨艳辉;靳淼;段招军
作者机构：
国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，北京 100052
文献出处：
引用格式：
[1]韦杏燕;朱曦;章青;孔翔羽;王萌璇;杨艳辉;靳淼;段招军-.我国诺如病毒GII.6[P7]重组株基因组进化分析)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(05):501-507
A类：
CaliciNet,NHBGR59
B类：
诺如病毒,GII,P7,重组株,基因组进化,进化特征,关键位点,点变异,变异情况,监测网络,China,阳性样本,基因组扩增,GenBank,ORF1,ORF2,贝叶斯进化分析,Simplot,重组分析,碱基,换速,10
,VP1,基因型,衣壳,6a,6b,6c,毒株,一簇,定本,株重,连接处,氨基酸位点,P2,结合位点,急性胃肠炎
AB值：
0.302439
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