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2018-2019年安徽省柯萨奇病毒A组16型B1基因亚型分离株分子特征分析
文献摘要：
目的 了解安徽省2018-2019年手足口病(HFMD)柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分子病原学进化特征.方法 对安徽地区2018-2019年从HFMD患者咽拭子样本中分离的CV-A16毒株,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增其VP1基因全长核酸片段、测定其核苷酸序列.采用肠道病毒在线分型工具鉴定CV-A16毒株基因亚型,运用MEGA 6.0生物软件最大似然法(maximum likelihood method)构建VP1基因进化树、MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性.结果 安徽省2018-2019年共分离到HFMD CV-A16毒株88株.其中2018年分离到30株,2019年58株.其VP1区全长基因均由891个核苷酸碱基组成,编码297个氨基酸.基因分型鉴定和进化分析显示,88株CV-A16毒株中B1a和B1b基因亚型分别为25株(28.41％)、63株(71.59％).VP1区遗传进化表明,88株CV-A16毒株均归为B1基因型,其中25株属于B1a基因亚型,63株属于B1b基因亚型.同源性分析显示,B1a基因亚型毒株与CV-A16原型株G-10核苷酸同源性为64.1％～65.3％,氨基酸同源性为90.3％～91.1％;B1b毒株与原型株核苷酸及氨基酸同源性分别为62.8％～66.0％和91.1％～91.8％.88株CV-A16与原型株VP1区氨基酸序列比较发现26个氨基酸位点出现变异.结论 安徽地区2018-2019年HFMD CV-A16毒株以B1b与B1a共同流行,B1b为优势基因亚型,应重视CV-A16流行毒株的分子病原学监测.
文献关键词：
柯萨奇病毒A组16型;手足口病;B1基因亚型;进化分析
中图分类号：
作者姓名：
史永林;葛盈露;马婉婉;孙永;吴家兵;苏斌
作者机构：
安徽省疾病预防控制中心,安徽省公共卫生研究院,安徽省医疗卫生重点实验室,安徽合肥230601
文献出处：
引用格式：
[1]史永林;葛盈露;马婉婉;孙永;吴家兵;苏斌-.2018-2019年安徽省柯萨奇病毒A组16型B1基因亚型分离株分子特征分析)[J].疾病监测,2022(08):1027-1032
A类：
B类：
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AB值：
0.282312
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